接着,我们用 cmake 编译 LAMMPS,把能开启的包全部开启,尽可能地覆盖大多数用户: mkdir buildcdbuildif[${float_prec}=="high"];thenexportPREC_DEF="-DHIGH_PREC"fiif[${dp_variant}=="gpu"];thenexportDEEPMD_CUDA_LINK="-ldeepmd_op_cuda"fiARGS="-D PKG_ASPHERE=ON -DPKG_BODY=ON -D PKG_CLA...
因此,我们要给 LAMMPS 的 cmake 文件打上补丁,加上这个 package: 现在,我们可以继续编写 了。首先配置 plumed: 接着,我们用 cmake 编译 LAMMPS,把能开启的包全部开启,尽可能地覆盖大多数用户: 我们通过 cmake 的参数开启了一坨 LAMMPS 的 package,同时通过配置 加入了对 libdeepmd 的链接。同时,我们通过环境...
安装conda后,使用以下命令安装GPU版: conda install deepmd-kit=*=*gpu lammps-dp=*=*gpu -c deepmodeling 将gpu改为cpu即可安装CPU版: conda install deepmd-kit=*=*cpu lammps-dp=*=*cpu -c deepmodeling 如需指定版本,需将两个等号中间的*号改为版本号: conda install deepmd-kit=1.3=*cpu lammps-dp...
make install make lammps mkdir -p$/share mv USER-DEEPMD$/share 指 检测到的核心数。现在,大功告成!接下来我们就可以开始编译集成了 DP 的 LAMMPS 以及 AmberTools。 : 如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
conda create -n deepmd deepmd-kit lammps -c conda-forge While this does indeed run, this command does - I believe - install the stock version of Lammps from the lammps package and not a version of Lammps with this Lammps deepmd pairstyle included (i.e. not lammps-dp). ...
首先一定是要换源, 这里建议清华镜像, 速度虽然不稳定, 但是多等等还是可以的… 改完之后千万记得conda clean -i刷新缓存, 最好使用conda info查看当前的镜像是否正确更换. 一个可选的操作是conda update --all更新包, 如果担心依赖等问题其实可以不进行更新...
2.4. Install LAMMPS 2.5. Install i-PI 2.6. Install GROMACS with DeePMD-kit 2.7. Building conda packages 2.8. Install Node.js interface 2.9. Easy install the latest development version 3. Data 3.1. System 3.2. Formats of a system 3.3. Prepare data with dpdata ...
近日,我已经通过conda-build[1]构建了deepmd-kit(含lammps模块)的conda packges[2],并用constructor[3]打包了离线安装包。下介绍安装方法及注意事项: 一、conda安装 安装conda后,使用以下命令安装GPU版: conda install deepmd-kit=*=*gpu lammps-dp=*=*gpu -c deepmodeling ...
conda build 系列教程・deepmd 的构建④|lammps-dp 在搞定libdeepmd 的构建后,我们终于来到了最后一关:LAMMPS。 这里以今年 3 月发布的 LAMMPS stable_3Mar2020 为例。在寻常的安装中,我们需要把 USER-DEEPMD 文件夹拷进 src 目录下,这次也不例外,我们在 build.sh 的最开头便做了这件事:cp -r${PREF… ...
make -j${CPU_COUNT}make install make lammps mkdir -p${PREFIX}/share mv USER-DEEPMD${PREFIX}/share ${CPU_COUNT}指conda-build检测到的核心数。现在,大功告成!接下来我们就可以开始编译集成了 DP 的 LAMMPS 以及 AmberTools。