fix output_msd oxygen ave/time 10 200 ${interval} c_msd[1] c_msd[2] c_msd[3] c_msd[4] file ${filename1}-ice-msd.dat #时间步2000步内,取每隔10步取一个数,共200个数,进行平均 fix output_mmttemp all ave/time 10 200 ${interval} c_mmt c_mmtdown c_mmtup file ${filename1}-...
LAMMPS是一款基于分子动力学(MD)方法的模拟器,可以模拟原子和分子的运动和相互作用。在纳米切削模拟中,LAMMPS可以模拟切削过程中原子间的相互作用、切削力、切削热、材料去除机制等,从而帮助研究人员理解纳米切削的物理过程和优化切削参数。 二、LAMMPS纳米切削模拟...
通过激光加热纳米颗粒的LAMMPS模拟,可以优化激光加热过程。例如,可以通过模拟不同激光参数和纳米颗粒物理特性下的温度分布和热传导过程,优化激光加热过程,实现对纳米颗粒温度的精确控制。此外,还可以通过模拟不同激光参数和聚合物材料物理特性下的温度分布和热传导过程,优化激光加热聚合物材料...
在材料研究中,退火可以用来模拟材料的结构和性质,并通过优化算法寻找能量最低的材料结构。而在物理化学领域,退火则可以用来研究原子或分子的热力学性质。 退火的基本原理是通过改变系统的温度,使系统逐渐从高能态向低能态转变,最终达到能量最低的状态。在计算中,我们通常采用分子动力学模拟的方法。其中,LAMMPS(Large-...
variable MAKE 在cmake解压完的文件夹中sudo apt-get install build-essential后继续./configure即可 ...
1.并发原子连续统方法的并行算法2022年8月《计算物理学报》第463卷C期doi.org/10.1016/j.jcp.2 2.维护无限图形流的连接组件2013 年 8 月.BigMine '13:第二届大数据、流和异构源挖掘国际研讨会论文集:算法、系统、编程模型和应用doi.org/10.1145/2501221 3.为百亿亿次级计算平台实现颗粒应用2021 年 11 月国...
关于如何设置LAMMPS中的真空层,一种常见的方法是在模拟盒子的上方留出一部分空间作为真空层。这可以通过调整盒子的尺寸来实现。然后,为了确保原子不会扩散到真空层中,需要设置适当的边界条件。在LAMMPS中,可以通过设置边界原子的质量为无穷大来实现固定边界条件,这样原子在接近真空层时会受到强力的束缚,不会...
在LAMMPS中进行非晶退火模拟,需要设置合适的温度、时间、边界条件等参数,以模拟材料在退火过程中的行为。 三、模拟参数设置 在进行非晶退火模拟时,需要选择合适的模型、参数和计算方法,以获得可靠的模拟结果。其中,模型的选择包括原子模型、势函数模型等,参数的选择包括温度、时间、压力等,计算方法的选择包括分子动...
c = avgr(avgc_ovito(ovito_atoms, 'Position.Z'))*2 print(a,b,c) 3.点击“Compute”按钮,进行计算。 4.在右侧菜单栏中选择“Console”,可以看到计算得到的晶格参数。 使用Python处理数据的方法如下: 1.打开Python,使用pandas库读取LAMMPS的输出文件,例如: import pandas as pd data = pd.read_csv('d...
近期有些初学LAMMPS的同学发给我一些他们写的in文件,让我帮忙修改一下错误以便顺利运行,看到这些同学写的in文件,似乎看到了两年前自己初学LAMMPS时写的in文件时的样子,即其中内容杂乱无章,书写逻辑只有自己知道,自己调试起来都非常麻烦,更别说让其他人帮你改错了,所以今天就拿...