我们用BUILD_LIB=on和BUILD_SHARED_LIBS=on开启了 shared libs 模式,这样,LAMMPS 会产生三类文件:LAMMPS 的 library、LAMMPS 的执行程序、Python package。如何将它们生成不同的库?这时我们需要用到meta.yaml里的outputs选项: outputs:-name:liblammps-dpfiles:-lib/liblammps.so*-lib/pkgconfig/liblammps.pc-share...
因此,我们要给 LAMMPS 的 cmake 文件打上补丁,加上这个 package: 现在,我们可以继续编写 了。首先配置 plumed: 接着,我们用 cmake 编译 LAMMPS,把能开启的包全部开启,尽可能地覆盖大多数用户: 我们通过 cmake 的参数开启了一坨 LAMMPS 的 package,同时通过配置 加入了对 libdeepmd 的链接。同时,我们通过环境...
Conda packages for GROMACS and LAMMPS Install conda First you should install conda. In order to do so execute the commands below: wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O miniconda.sh # on MacOS replace with: # wget -c https://repo.continuum.io...
https://docs.lammps.org/plugin.html Thank you for clarifying - and for the quick reply. Though I am a bit puzzled; on my Ubuntu workstation, installing the packages via the deepmodeling channel does indeed provide a version of Lammps that does not need the plugin activated to utilize the ...
近日,我已经通过conda-build[1]构建了deepmd-kit(含lammps模块)的conda packges[2],并用constructor[3]打包了离线安装包。下介绍安装方法及注意事项: 一、conda安装 安装conda后,使用以下命令安装GPU版: conda install deepmd-kit=*=*gpu lammps-dp=*=*gpu -c deepmodeling ...
make -j$ make install make lammps mkdir -p$/share mv USER-DEEPMD$/share 指 检测到的核心数。现在,大功告成!接下来我们就可以开始编译集成了 DP 的 LAMMPS 以及 AmberTools。 : 如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
首先一定是要换源, 这里建议清华镜像, 速度虽然不稳定, 但是多等等还是可以的… 改完之后千万记得conda clean -i刷新缓存, 最好使用conda info查看当前的镜像是否正确更换. 一个可选的操作是conda update --all更新包, 如果担心依赖等问题其实可以不进行更新...
1. Easy install 2. DeePMD-kit Quick Start Tutorial Advanced 1. Backend 2. Installation 2.1. Easy install 2.2. Install from source code 2.3. Install from pre-compiled C library 2.4. Install LAMMPS 2.5. Install i-PI 2.6. Install GROMACS with DeePMD-kit ...
Issue LAMMPS is built against libpnetcdf, but never add it to the requirements. When installing a LAMMPS version built against the old libpnetcdf package (libpnetcdf.so.4) (for example, 2023.8.2), the error appears ./bin/lmp: error while loading shared libraries: libpnetcdf.so.4: ...
2019年10月24日(UTC-4)微信公众号近日,我已经通过conda-build[1]构建了deepmd-kit(含lammps模块)的conda packges[2],并用constructor… 阅读全文 conda install——无root权限时一键安装软件 conda install --channel "anaconda" package安装Anaconda 使用conda install需要安装Anaconda,安装方式见此。 但也可以用...