CLC是一款全图形化界面的综合性生物信息学分析工具,迄今已近20年的历史。它支持个人电脑、本地服务器、AWS等多种部署模式,目前已有超过3万篇文献引用。CLC能够完成单细胞RNA-seq数据分析、单细胞ATAC-seq数据分析、宏基因组数据分析、扩增子数据分析、耐药基因分析、WGS/WES重测序数据分析、转录组数据分析、甲基化数据...
CLC Genomics Workbench Premium是一款综合性生物信息学分析工具,其中的单细胞模块能够完成scRNA-seq、scTCR-seq、scBCR-seq、scATAC-seq、CITE-seq、TotalSeq、BEAM、Visium空间组学等数据的分析。近日,CLC单细胞模块发布了今年的第二次更新,包括reads注释和Parse Biosciences分析工具。 01、注释单细胞Reads Annotate Sin...
CLC Genomics Workbench Premium是一款综合性生物信息学分析工具,其中的单细胞模块能够完成scRNA-seq、scTCR-seq、scBCR-seq、scATAC-seq、CITE-seq、TotalSeq、BEAM、Visium空间组学等数据的分析。 近日,CLC单细胞模块发布了今年的第二次更新,包括reads注释和Parse Biosciences分析工具。 01、注释单细胞Reads Annotate S...
By contrast, transcriptome sequencing (RNA-seq) can be used to identify the alleles being expressed. Such knowledge is crucial for the identification of drug-resistance variants and effective drug targets.A. ArensAM. HeinU. AppeltA. Joecker...
RNA-seq的分析常用来检测差异基因,CLC在进行数据的质控后,可计算基因和转录本的表达值,比如Total Counts, Unique Counts, TPM和RPKM,然后将统计结果进行可视化选项进行可视化:火山图,热图,PCA图和维恩图等。 Ingenuity Pathway Analysis(IPA) IPA搭建了Ingenuity Knowledge Base(IKB)知识库。该数据库自1998年起开始构建...
PCA for RNA-Seq Principal Component Analysis makes it possible to project a high-dimensional dataset (where the number of dimensions equals the number of genes or transcripts) onto two or three dimensions. This helps in identifying outlying samples for quality control, and gives a feeling for ...
使用元数据查找对象,在批处理中定义输入的分组,在工作流中引导样本到不同的路径(例如在肿瘤-正常或三重研究中),或在RNA-Seq的统计分析和可视化中。你所需要的只是一个Excel电子表格。 6、高级配料制作简单 你的研究可能会提供很多样本,但我们会支持你的分析。工作流使分析大量批次变得容易,即使涉及到许多工具,并且...
Explore case studies Need more capabilities? Are you looking for NGS, RNA-seq or biomedical genomics analyses? Upgrade to our premium solution Dig into the details We’re always cooking up new tools, bug fixes and plugins. See recent improvementsSee system requirements...
CLC Genomics Workbench适用于遗传学、转录组学和表观遗传学研究。其包含多种功能,包括独特的read mapping和基因组从头组装功能,还为再次测序、ChIP-seq和RNA-seq提供相关应用。 Product Resources 安全数据表 (1) 产品介绍与指南 (1) 安全数据表 (10)
Import Expression Data imports RNA-seq expression values from Excel, CSV or TSV files. This tool was formerly distributed in the Ingenuity Pathway Analysis plugin. Files in AWS S3 buckets can be browsed using the Remote Files tab, available to the right of the Navigation Area tab. This tab ...