CLC Genomics Workbench功能 对来自上述测序平台产出的原始数据的质量控制,包括原始数据的质量评估和data trimming以及PCR duplication的去除。多样本数据的自动分离。基因组数据的从头组装、重测序数据的mapping、SNP/InDel/CNV/SV突变检出和注释、比较基因组数据的分析以及结果的图形化展示。RNA-seq数据的差异表达分析和统计...
RNA-Seq与表达分析的改进 ◆在RNA-Seq分析中,改进了对chimeric protocols的支持。 ◆ RNA-Seq分析在“Distribution of biotypes”表中报告频率为0的生物型。 ◆ 当包含在工作流中时,可以仅使用一个样本作为输入来运行PCA for RNA-Seq和Create Heat Map for RNA-Seq,从而使它们能够用于多样本和单样本分析。 ◆...
CLC Genomics Workbench覆盖遗传学、转录组学和表观遗传学研究所需的多种功能。 Applications CLC Genomics Workbench适用于遗传学、转录组学和表观遗传学研究。其包含多种功能,包括独特的read mapping和基因组从头组装功能,还为再次测序、ChIP-seq和RNA-seq提供相关应用。
You can depend on CLC Genomics Workbench Premium for your entire analysis journey, from raw sequencing files to publication-ready visuals. Access workflows for de novo assembly of whole genomes and transcriptomes, resequencing analysis, variant calling, RNA-seq, DNA methylation and...
基因表达分析和转录组学是生物信息学中的重要领域,通过对RNA测序(RNA-seq)数据的分析,可以了解基因在不同条件下的表达水平,从而揭示生物学过程和疾病机制。CLCGenomicsWorkbench提供了强大的工具和支持,使得这些分析变得更加高效和准确。本节将详细介绍如何使用CLCGenomicsWorkbench进行基因表达分析和转录组学研究,包括数据的...
CLC bio has released its Next Generation Sequencing (NGS) solution, CLC Genomics Workbench, which incorporates cutting-edge technology and algorithms, while also supporting and integrating with the rest of a typical NGS workflow.
CLC Genomics Workbench 的 Bisulfite Sequencing 插件为科学家在研究胞嘧啶甲基化时面临的常见问题提供了一体化解决方案。 ♦ RNA-seq 软件将测序数据的标准二级分析和高级统计方法结合到一起,并且提供case-control、多组实验以及多因素实验的设计。所有工具都可以解决由于测序深度引起的差异,无需对输入数据进行标准化...
CLC Genomic WorkbenchIngenuity pathway analysis (IPA)RNA sequencing (RNA-seq)RNA sequencing (RNA-seq) is a recently developed approach to perform transcriptome profiling using next-generation sequencing (NGS) technologies. Studies have shown that RNA-seq provides accurate......
这里导入的测序数据根据测序平台导入。转录组,smRNA测序等二代测序基本都是illumina,选择双端测序文件后会自动将2部分数据合在一起,所以导入以后只要一个数据文件。 2.导入clean reads 一直next,save 3.导入文件蓝色标注这个样子,它包含了正反两个测序文件 ...
CLC Genomics Workbench可以实现:对来自上述测序平台产出的原始数据的质量控制,包括原始数据的质量评估和data trimming以及PCR duplication的去除。多样本数据的自动分离。基因组数据的从头组装、重测序数据的mapping、SNP/InDel/CNV/SV突变检出和注释、比较基因组数据的分析以及结果的图形化展示。RNA-seq数据的差异表达分析和...