lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA调控关系如Sankey图(图7H和图7I)。总共5个lncRNA、6个circRNA、8个miRNA和5个mRNA构成了ceRNA网络(图7J)。 5.关键基因在肝细胞癌中的诊断和预后价值 对ceRNA网络中的关键基因进行ROC曲线分析。结果表明,所有mR...
1.创新点 首次在OA软骨细胞中发现了由16个differentially expressed circRNAs(DECs)、32个DETMs(target DEMs)和97个DETGs(target DEGs)构成的circRNA-miRNA-mRNA调控网络;hsa_circ_0027914、hsa_circ_0101125和hsa_circ_0102564被确定为在OA中的中心DECs。体外验证实验表明这三种中枢DECs的促凋亡功能及其作为OA新生物标...
2个miRNA和40个circ-RNA,构建了256个mRNA-miRNA-circRNA调控网络;在此生物信息学分析的基础上,通过临床PCOS患者的收集的卵丘颗粒细胞标本进行RT-qPCR验证,显示mRNA(PAPPA)、miRNA(hsa-miR-127-3p)和circRNA(hsa_circ
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由中国湖北同济医学院的科学家们领导的一项新研究调查了ceRNA网络,以更好地了解HCC中复杂的基因相互作用,并确定诊断和治疗HCC的潜在生物标志物。 他们的研究结果发表在《Aging-US》杂志上的一篇题为“Comprehensive analysis of the competing endogenous circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA network and identification of a novel...
CircRNA除了直接影响mRNA转录外,还可以通过海绵作用于miRNAs或RNA结合蛋白来调控靶基因的表达。本文将重点介绍CircRNA-miRNA-mRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症中影响基因表达的研究进展。 图片来源:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34853728/ CircRNA的功能 ...
CircRNA除了直接影响mRNA转录外,还可以通过海绵作用于miRNAs或RNA结合蛋白来调控靶基因的表达。本文将重点介绍CircRNA-miRNA-mRNA相互作用网络在糖尿病及其相关并发症中影响基因表达的研究进展。 CircRNA的功能 一组不同的CircRNA已被确定为具有海绵、诱饵或改变基因或蛋白质表达的可翻译元件等功能。CircRNAs可以通过海绵的作...
一个miRNA可能有多个目标circRNA,它也可以调节几个不同的mRNAs,因此,可以存在许多由该miRNA介导的串扰,形成一个ceRNA网络。这样的网络可用于检测癌症生物标志物、早期诊断模式 和癌症治疗的新概念。 竞争规则规定,当ceRNA的表达水平非常高时,ceRNA可以竞争与miRNA的结合并降低miRNA的表达水平。由于 miRNA 的表达水平较低...
ncRNA调控网络的动态平衡在机体稳态的维持中具有重要作用,异常调控将导致疾病的发生。环状RNA(circRNA)主要涉及心血管疾病(CVD)演化,对miRNA起海绵作用,继而调控miRNA以及其靶点mRNA功能。本文章将对circRNA- miRNA-mRNA轴在CVD中的新作用作一总结,重点介绍circRNA参与心脏保护作用的机制。
研究人员对油菜细胞质雄性不育系进行了全转录组测序,鉴定出一些与花药发育相关的基因、circRNA和miRNA,利用Cytoscape构建mirna介导的调控网络和ceRNA网络,重构了这些RNAs之间的调控关系,并对于关键的子网络相关基因进行了功能注释分析,挖掘出调控的关键功能通路,加深了对花药发育及雄性不育的理解。