1、 关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq1)染色质:真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质,这种物质的基本化学成分为脱氧核糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体),主要由DNA和组蛋白构成,也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色,所以称为染色质。在细胞的有丝...
这表明OsJMJ718可能是一种组蛋白H3K9me 1/3去甲基化酶(图3) 图3. OsJMJ718是H3K9me1/3去甲基化酶 4、OsJMJ718活性的功能丧失导致数千个基因的H3K9me3增加 作者进一步研究OsJMJ718是否通过靶基因的H3K9me3水平调节其表达,为此进行了ChIP-seq,以分析WT和OsJMJ718-CR萌发种子中的全基因组H3K9me3谱。OsJMJ71...
组蛋白甲基化修饰工具(H3K4me3 ChIP-seq)组蛋白甲基化类型也有很多种,包括赖氨酸甲基化位点H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79和H4K20等。组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰(H3K4)在进化上高度保守,是被研究最多的组蛋白修饰之一。 DNA亲和纯化测序DNA亲和纯化测序技术通过体外表达转录因子鉴定转录因子结合位点,不...
H3K4me3 ChIP-seq是一种用于研究组蛋白甲基化的技术。它专注于组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰,这是基因激活的重要标志。 H3K4me3 ChIP-seq的优势高通量检测: 这项技术能够高通量地检测基因组上的H3K4甲基化修饰,为研究者提供了丰富的数据。跨物种应用: 它的抗体已经完全商业化,可以用于多个物种的检测。多年实验...
表观遗传学新视角:H3K4me3 ChIP-seq技术/DNA亲和纯化测序/组蛋白甲基化/特异性抗体/互作组/表观组/甲基化检测/赖氨酸甲基/高通量测序/转基因, 视频播放量 11、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 Ai张蒙, 作者简介 ,相关视频:组蛋白甲
染色质免疫共沉淀是组蛋白甲基化chipseq的关键步骤,用于将特定的甲基化组蛋白从杂质中分离并富集。该步骤通常包括以下步骤:先交联抗体和靶蛋白,使其形成的复合物不会被细胞质内的酶降解而失活;再使用蛋白A/G磁珠将复合物与染色质一起共沉淀下来,随后通过排除杂质和洗脱样品来分离特定的甲基化组蛋白。 4. DNA片段...
关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq 1)染色质：真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质，这种物质的基本化学成分为脱氧核 糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体)，主要由DNA和组蛋白构成，也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色，所以称为染色质。在细胞的有丝...
它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质dna复合物并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段然后通过免疫学方法沉淀此复合体特异性地富集目的蛋白结合的dna片段通过对目的片断的纯化与检测从而获得蛋白质与dna相互作用的信息 关于组蛋白、甲基化、CHIP-Seq、结合位点、转录因子 关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合...
JmjC家族蛋白是一类重要的组蛋白赖氨酸去甲基化酶,在调控基因表达和水稻发育中具有一定的功能。此研究利用RT-qPCR检测种子萌发过程中的JmjC基因表达水平,发现OsJMJ718可能参与了种子萌发。OsJMJ718序列为6468bp,包含7个外显子和6个内含子(图1a),其ORF长1140bp,编码一个380aa的预测蛋白。进化分析表明,OsJMJ718与拟...
(4)叶片和种子中五种组蛋白修饰的ChIP-seq分析,结果表明绝大部分组蛋白修饰位点(90%)主要在DMV中富集,且在叶片中,种子特异表达基因主要被抑制性组蛋白修饰所占据,而在种子形成过程中,这些种子特异基因主要被激活性组蛋白修饰占据,表明DMV可以通过组蛋白修饰的重排来调控种子关键基因的特异表达。