1、 关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq1)染色质:真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质,这种物质的基本化学成分为脱氧核糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体),主要由DNA和组蛋白构成,也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色,所以称为染色质。在细胞的有丝...
本研究应用MeRIP-seq,ChIP-seq,RNA-seq等技术,通过敲除N-Myc以及抑制 mTOR 诱导胚胎干细胞暂停发育等手段,探索RNA修饰在休眠期转录休眠调控中的潜在功能,发现小鼠胚泡和胚胎干(ES)细胞的发育暂停需要 Mettl3 对 N6 -甲基腺苷(m6A)RNA 进行甲基化,并且揭示了Mettl3对发育暂停期间的整体转录起抑制作用,其染色质招募...
组蛋白甲基化修饰工具(H3K4me3 ChIP-seq)组蛋白甲基化类型也有很多种,包括赖氨酸甲基化位点H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79和H4K20等。组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰(H3K4)在进化上高度保守,是被研究最多的组蛋白修饰之一。 DNA亲和纯化测序DNA亲和纯化测序技术通过体外表达转录因子鉴定转录因子结合位点,不...
D. BRWD3依赖性调控H3K4甲基化水平模型。BRWD3靶向KDM5降解。在BRWD3缺失情况下,KDM5活性增加,导致H3K4me3去甲基化,从而促进H3K4me1水平升高。 研究意义: H3K4甲基化与基因转录活性相关,但调控H3K4me3水平的机制尚不清楚。本研究分析了BRWD在调控H3K4甲基化中的作用,BRWD3是一种染色质结合蛋白和Cul4DDB1泛素连接...
什么是H3K4me3 ChIP-seq? H3K4me3 ChIP-seq是一种用于研究组蛋白甲基化的技术。它专注于组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰,这是基因激活的重要标志。 H3K4me3 ChIP-seq的优势高通量检测: 这项技术能够高通量地检测基因组上的H3K4甲基化修饰,为研究者提供了丰富的数据。跨物种应用: 它的抗体已经完全商业化,可以用于...
技术平台:MeRIP-seq、ChIP-seq、RNA-seq等 研究摘要: 在后生动物谱系中,胚胎可以进入可逆的发育暂停或滞育状态,以应对不利的环境条件。这种显著休眠状态下的分子机制仍不清楚。本研究表明Mettl3引起的N6-甲基腺苷(m6A) RNA甲基化是小...
该研究通过染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)等分析揭示了BRWD3促进组蛋白去甲基化酶 5(lysine-specific demethylases 5,KDM5)降解以维持H3K4甲基化水平。 标题:BRWD3 promotes KDM5 degradation to maintain H3K4 methylation levels(BRWD3促进KDM5降解以维持H3K4甲基化水平)...
本研究应用MeRIP-seq,ChIP-seq,RNA-seq等技术,通过敲除N-Myc以及抑制 mTOR 诱导胚胎干细胞暂停发育等手段,探索RNA修饰在休眠期转录休眠调控中的潜在功能,发现小鼠胚泡和胚胎干(ES)细胞的发育暂停需要 Mettl3 对 N6 -甲基腺苷(m6A)RNA 进行甲基化,并且揭示了Mettl3对发育暂停期间的整体转录起抑制作用,其染色质招募...
图4:人类精子中H3K4me3和DNA甲基化谱 H3K4me3 peaks和DNA甲基化之间的重叠显示在基因组浏览器快照中,显示了HOXA发育基因簇(A)的ChIP-seq轨迹(蓝色)、MACS2 calling的H3K4me3 peaks(深蓝色)、WGBS轨迹(黑色)、CpG岛位点轨迹(红色,UCSC)和GC百分比热图(蓝色,低GC %;白色,50% GC;红色,高GC %),染色质修饰蛋白ARI...
关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq 1)染色质：真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质，这种物质的基本化学成分为脱氧核 糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体)，主要由DNA和组蛋白构成，也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色，所以称为染色质。在细胞的有丝...