1、 关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq1)染色质:真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质,这种物质的基本化学成分为脱氧核糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体),主要由DNA和组蛋白构成,也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色,所以称为染色质。在细胞的有丝...
组蛋白H3第4位赖氨酸的甲基化修饰(H3K4)在进化上高度保守,是被研究最多的组蛋白修饰之一。 DNA亲和纯化测序DNA亲和纯化测序技术通过体外表达转录因子鉴定转录因子结合位点,不受抗体和物种限制,且具有高通量的优势。DAP-Seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,所以具有...
通过整合ChIP-seq和RNA-seq的分析,在OsJMJ718-CR系中分别获得了因H3K9me3水平升高或降低造成表达变化的1217个基因和19个基因。KEGG和GO富集分析显示,这1236个基因与植物激素信号途径密切相关(图4c)。3个ABA信号转导途径基因(OsPP2C30,OsWRKY24和OsEMP1)、3个GA相关基因(OsWRKY53,OsGA3和OsGASR9)和2个乙烯相...
DAP-Seq,即DNA亲和纯化测序技术,是一种创新的基因组分析方法。它通过体外表达转录因子,精确地鉴定转录因子与基因组的结合位点。与传统的ChIP-seq相比,DAP-Seq不受抗体和物种的限制,使得研究者能够探索更广泛的生物体系。 DAP-Seq的优势高通量检测: DAP-Seq能够一次性检测成千上万的转录因子结合位点,大大提高了研究...
染色质免疫共沉淀是组蛋白甲基化chipseq的关键步骤,用于将特定的甲基化组蛋白从杂质中分离并富集。该步骤通常包括以下步骤:先交联抗体和靶蛋白,使其形成的复合物不会被细胞质内的酶降解而失活;再使用蛋白A/G磁珠将复合物与染色质一起共沉淀下来,随后通过排除杂质和洗脱样品来分离特定的甲基化组蛋白。 4. DNA片段...
组蛋白甲基化修饰:汇智生物的H3K4me3 ChIP-seq技术/组蛋白/甲基化检测/DNA/赖氨酸甲基/表观组/互作组/DAP-Seq/异性抗体/测序分析 3839 -- 0:23 App 顶级水刊!!超级好发的SCI期刊!! 2800 1 1:41:42 App 手把手精读SCI论文1/100 | 细胞死亡 坏死性凋亡 CDD IF23.7 <肝细胞中RIPK3甲基化修饰抑制MLKL坏...
关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq 1)染色质：真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质，这种物质的基本化学成分为脱氧核 糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体)，主要由DNA和组蛋白构成，也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色，所以称为染色质。在细胞的有丝...
它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质dna复合物并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段然后通过免疫学方法沉淀此复合体特异性地富集目的蛋白结合的dna片段通过对目的片断的纯化与检测从而获得蛋白质与dna相互作用的信息 关于组蛋白、甲基化、CHIP-Seq、结合位点、转录因子 关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合...
关于组蛋白、甲基化、转录因子、结合位点和CHIP-Seq 1)染色质：真核细胞分裂间期的细胞核内的一种物质，这种物质的基本化学成分为脱氧核 糖核酸核蛋白(核蛋白就是由DNA或RNA与蛋白质形成的复合体)，主要由DNA和组蛋白构成，也含有少量的非组蛋白和RNA。由于它可以被碱性的染料染色，所以称为染色质。在细胞的有丝...
(4)叶片和种子中五种组蛋白修饰的ChIP-seq分析,结果表明绝大部分组蛋白修饰位点(90%)主要在DMV中富集,且在叶片中,种子特异表达基因主要被抑制性组蛋白修饰所占据,而在种子形成过程中,这些种子特异基因主要被激活性组蛋白修饰占据,表明DMV可以通过组蛋白修饰的重排来调控种子关键基因的特异表达。