ChIP & ChIP-Seq实验原理与成功要素及测序数据分析解读 解螺旋官方频道 11:36 ChIP-seq analysis SZ-ZS 12150 【生信技能树】全外显子测序数据分析重制课程-1-15 Apollo_胸外 34:37 CHIP-seq原理和分析流程精讲 SeanLucasぃ 1.4万29 04:43 什么是DAP-seq ...
整体把握CHIP-seq图谱特征:peak/reads在基因组上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距离TSS位点的距离分析、peak修饰基因的功能分析筛选具体差异peak和基因:差异 peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异peak关联基因的功能分析、差异peak关联基因的PPI分析、感...
所以,我们测序测到20 M有效片段就够了。 至于ChIP-seq的生信分析流程,见下图: 在ChIP-seq实验中,做不做IgG呢? 我们的客户也经常说要做IgG,当然,可能是ENCODE上这么写了:Each ChIP-seq experiment should have a corresponding input or IgG control experiment with matching run type, read length, and replica...
ChIP-seq高通量测序数据分析系统是由武汉康测科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2018SR155355,属于分类,想要查询更多关于ChIP-seq高通量测序数据分析系统著作的著作权信息就到天眼查官网!
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比较:估计ChIP peak数据集中重叠部分的显著性;整合GEO数据集,以便于将当前结果和已知结果比较。 peak的覆盖情况;TSS区域结合的peak的平均表达谱和热图;基因组注释;TSS距离;peak和基因的重叠。 download packages source ("https://bioconductor.org/biocLite.R") ...
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seq共沉淀chip染色免疫数据 染色质免疫共沉淀-测序(ChIP-Seq)技术及数据分析方法介绍薇1,刘若水2杨(1.国家电网许继集团,河南许昌461000;2.京豫信息中心,北京100021)摘要:对ChIP-Seq技术的实验原理进行了介绍,而且对ChIP-Seq数据分析过程的每一个步骤都进行了详细的说明,对用到的程序给出了如何使用的例子.对ChIP...
自学CHIP-seq分析第五讲~测序数据比对 比对本质是是很简单的了,各种mapping工具层出不穷,我们一般常用的就是BWA和bowtie了,我这里就挑选bowtie2吧,反正别人已经做好了各种工具效果差异的比较,我们直接用就好了,代码如下: ## step5 : alignment to hg19/ using bowtie2 to do alignment...