http://cistrome.org/db/#/数据库简单寻找蛋白已有的ChIP-seq数据 确定物种及所需要查询的蛋白,一般生物过程不操作,在限制条件中选择高质量的过滤条件,保证数据的可靠性,选择自己感兴趣的肿瘤类型进行观察 点击UCSC Browser,即可进入ucsc进行se...
1. 下载数据选择数据源:常用的数据库有GEO、TCGA、ENSEMBL等。确定数据类型:根据研究需求选择适合的RNA-seq、ChIP-seq、ATAC-seq等数据类型。数据下载工具:使用SRA Toolkit、GEOquery包等工具进行数据下载。 2. 数据清洗质量控制:使用FastQC等工具对数据进行质量评估。去除低质量数据:根据质量评估结果,去除低质量的reads...