观察到的共同峰的差异被认为反映了两个样本之间ChIP-Seq信号的比例关系,可以应用于所有峰。 MANorm可以用于: 两个ChIP-seq样本的标准化 两个ChIP-seq样本的定量比较(差异分析) 评估蛋白质结合位点(峰)的重叠富集 阐明细胞类型特异性基因调控的潜在机制 二、安装 MAnorm需要Python 3.6+ pip install -U manorm #...
基于ChIPseq数据HMM方法识别全基因组的差异组蛋白修饰位点摘要目的:表观遗传修饰是调控基因表达和基因组功能的一个主要因素。在不同的表观遗传修饰中,差异组蛋白修饰位点DHMSs是不同细胞类型时期和环境影响时,表观遗传动态性质和基因表达调
在不同的表观遗传修饰中,差异组蛋白修饰位点(DHMSs)是不同细胞类型、时期和环境影响时,表观遗传动态性质和基因表达调控的一个研究热点。为了测定全基因组的组蛋白修饰,ChIP-seq技术是一种有效的方法。因此,通过比较两个ChIP-seq文库可以识别潜在的DHMSs。 结果:我们的目的是识别DHMSs,提出一种称为ChIPDiff的方法...
在不同的表观遗传修饰中,差异组蛋白修饰位点(DHMSs)是不同细胞类型、时期和环境影响时,表观遗传动态性质和基因表达调控的一个研究热点。为了测定全基因组的组蛋白修饰,ChIP-seq技术是一种有效的方法。因此,通过比较两个ChIP-seq文库可以识别潜在的DHMSs。结果:我们的目的是识别DHMSs,提出一种称为ChIPDiff的方法来...