前年在中科院做培训时,整理了一套ChIP-seq分析流程,截选实战部分,略作修改,分享出来,希望大家指正。 那次培训内容比较杂,还有关于TCGA、ICGC、ProteinAtlas等数据库的使用, 前面已经分享过,链接如下: UCSC…
利用数据库(circAtlas2.0 database,circatlas.biols.ac.cn/; ENCORI database, starbase.sysu.edu.cn/; SPP database, https:// signalingpathways.org)分析发现,circRNA与LIG1启动子的结合蛋白有显著重叠,其中FOXA1是最显著的蛋白。进一步预测与FOXA1共同作用的蛋白,发现TET1与FOXA1结合。 调控互作复合体验证:在...
方便检索与查询,网址如下 https://chip-atlas.org...有些转录因子在行使功能时是通过蛋白复合体的形式来发挥作用,比如Pou5f1,Nanog, Sox2这三个转录因子,它们对应的peak区间在基因上的位置是非常的邻近的,Colocalization分析就是比较多个转录因子的chip...通过ChIP-Atlas网站,可以方便的查询已有的chip_seq数据结果...
帅到炸裂的头盔——Ruroc Atlas 4.0 水星 喜欢: 0 回复: 194zcx427706949 装机性价比三件套推荐—华擎B760 PRO RS+金百达黑刃DDR5、KP260PLUS实测 喜欢: 0 回复: 4Rogerhuling 黑金全塔海景房——ROG Z790 HERO+4080猛禽+追风者 NV7 装机展示 喜欢: 0 回复: 83yhgg 乱洒衰荷,颗颗真珠雨 喜欢: 0 回复: ...
Atlas Fallen 尘封大陆 VS Intel OC-ed:Assassin's Creed Mirage 刺客信条：幻景 F1 23 F1 ...
需要使用Linux环境,用conda配置好软件环境,走数据分析基本流程。 step4:两个ChIPseq数据取交集 前面我们下载了3个数据,是两个IP和一个INPUT,所以两个IP都是会有bed格式的peaks文件,简单的取交集就是图b, Pie chart showing the genomic distribution ofoverlapping TWIST1- and MYCN-bound sites. ...
但是呢,里面关于文献测序数据那一块其实是过气了,因为sra-tools的prefetch下载方式并不适合中国大陆的用户,简单的参考:使用ebi数据库直接下载fastq测序数据, 需要自行配置,其实就可以解决数据下载的问题啦。 数据下载仅仅是一个开始,后续的流程化分析才是大戏,也有很多粉丝follow了我们的教程完成了系列图表最后仍然是云里...
MXC9ATLAS-PMB 价格参考￥ 。 NXP MXC9ATLAS-PMB 封装/规格: -, BOARD ATLAS PM。你可以下载 MXC9ATLAS-PMB 中文资料、引脚图、Datasheet数据手册功能说明书,资料中有 开发板/评估板/验证板(废弃) 详细引脚图及功能的应用电路图电压和使用方法及教程 手机版: MXC9ATLAS-PMB...
拆解atlas资源脚本 请先安装PIL,因为这个是基于Image模块进行图片拆解的,python版本2.7.7 上传者:w88219003时间:2014-12-13 cocos框架游戏开发的demo.zip cocos框架游戏开发的demo.zip 上传者:qq_51320133时间:2024-04-19 安卓应用源码Anglev1.0-2D游戏引擎 ...
其实如果你看过我表观组学系列,比如《ChIP-seq数据分析》 和《ATAC-seq数据分析》 就会知道这些技术都可以被单细胞化, 如果你具备比较好的背景知识,理论上是可以自己根据文档把它们对应的单细胞水平的数据分析摸索成功。那就作为学徒作业吧,摸索scChIPseq数据分析流程