EM-seq测序通过将酶学转化法甲基化文库制备和靶向甲基化捕获系统相结合，共检测人基因组上123 Mb区域内的398万个CpG位点的甲基化状态。是癌症转移、人类发育和功能基因组学等各种应用中探索甲基化水平的理想选择。该方法覆盖范围广、检测灵敏度高，且降低了测序成本，适合进行大队列样本研究，尤其适用于cfDNA样本的甲基...
在往期微信中,我们深入探讨了EM-seq技术在液体活检领域的突破性进展(追溯癌症:cfDNA检测技术革新!),揭示了它在早期疾病诊断和治疗监测中的巨大潜力。然而EM-seq的应用远不止于此,它在多个研究领域都展现出了巨大潜力。 本期,跟随小编的脚步一起来看看前沿技术EM-seq在基因组DNA上的应用吧,让我们一起开启全新的研究...
5mC 目前是 研究得最清楚 表观遗传修饰,也是 最重 要的一种 修饰, 广泛存 在于植 物、动 物等真 核生物 基因组 中,称誉为 DNA的“ 第五碱基“,广泛参与胚胎发育、细胞分化、基因组稳定性维持、基因调控及各种疾病等方面,具有重要的基础医学及临床转化应用价值以cfDNA为检测对象的无创液体活检技术已经成为肿瘤...
All the bioinformatics processing and analysis for plasma and saliva cfDNA used in W Lab. Created by Irene Choi. Install all the required packages, softwares, and tools! NOTE: You only need to do this once. Hoffman2 has most dependencies already preinstalled. Follow the steps below to install...
这种测试方法称为游离甲基化DNA免疫沉淀高通量测序(cell-freemethylatedDNAimmunoprecipitationandhigh-throughputsequencing,cfMeDIP–seq),用于在不使用亚硫酸盐的情形下对血浆cfDNA进行全基因组甲基化分析。相关研究结果于2018年11月14日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Sensitivetumourdetectionandclassificationusingplasma...
Nat Commun:cfMeDIP-seq揭示cfDNA甲基化高效区分原发性和转移性前列腺癌 #Nature #发表论文 #表观遗传学 #DNA甲基化 #前列腺 - 易基因科技于20241010发布在抖音,已经收获了2个喜欢,来抖音,记录美好生活!
cfDNA片段化谱推断基因表达水平(EPIC-seq技术) 测序深度的增加提高了cfDNA推断基因表达水平的准确性,因此作者开发了一种基于cfDNA的TSS侧翼区域的定向深度测序与机器学习相结合的EPIC-seq技术,可以精准预测基因表达水平。为了验证这一概念,研究人员分别将EPIC-seq技术应用于实体肿瘤的非侵入式组织学分型和血液肿瘤的分子...
综上所述,这些结果表明 cfDNA 甲基化具有作为冠脉侧支循环等心血管疾病的预测工具的效用。 云序EM-seq样品要求 1)样品类型:患者的血浆、血清或 cfDNA。 血浆和血清相比较而言,推荐使用血浆,以减少淋巴细胞来源的 cfDNA 干扰。 2)样品量:血浆>5mL;血清>10mL;cfDNA>10 ng。
基于血液的cfDNA靶向甲基化检测法 ELSA-seq 能够高特异性的早期检测和定(溯)位(源)多种癌症。 " 如果说,Illumina看见了美国泛癌早筛圣杯(GRAIL)之光,不必羡慕。 因为,我们也见证了中国泛癌早筛燃石(Burning Rock)之光。 两种光,虽不一样,但均照亮了泛癌早筛之路!
基于血液的cfDNA靶向甲基化检测法 ELSA-seq 能够高特异性的早期检测和定(溯)位(源)多种癌症。 " 如果说,Illumina看见了美国泛癌早筛圣杯(GRAIL)之光,不必羡慕。 因为,我们也见证了中国泛癌早筛燃石(Burning Rock)之光。 两种光,虽不一样,但均照亮了泛癌早筛之路!