1、鉴定肺鳞癌中特异性过表达的lncRNA:生信分析(表达谱数据、TCGA数据)、RT-PCR等 2、过表达lncRNA临床相关性研究:ISH、Kaplan-Meier生存分析等 3、LncRNA体内外功能研究:shRNA、基因集富集分析(GSEA)、鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)实验、H&E染色、RT-PCR和ELISA等 4、LncRNA作为ceRNA促进肺鳞癌血管生成和进展的机制研...
?ceRNA调控基础—microRNA与lncRNA解螺旋|知识金牌 解螺旋 | 陪伴医生科研成长知识金牌本期课程 解螺旋 | 陪伴医生科研成长“经典”的ceRNA理论 知识金牌以microRNA为核心故事发生在胞浆中故事从MRE开始MRE即miRNA反应元件(miRNAresponseelements)是各类RNA上可以被miRNA结合的一小段序列区域mRNA、lncRNA或者cricRNA竞争性...
4. LncRNA 2810403D21Rik / Mirf通过Mir26a-Usp15轴调节自噬 (1)2810403D21Rik/Mirf通过调节Mir26a和Usp15调节自噬,促进NMCMs的心脏损伤 NMCM过表达2810403D21Rik / Mirf生存能力降低,并加重了H2O2的细胞活力抑制作用,减少NMCM中的自噬体和自噬溶酶体,增加SQSTM1和USP15的表达,并阻断LC3-II ATG7,BECN1和ATG5...
研究乳酸应答的LncRNA MIR17HG作为CeRNA，通过糖酵解介导的正反馈回路促进CRLM，可能成为CRLM的一个新的生物标志物和治疗靶点。
我们对构建的ceRNA网络中的每个DElncRNA,DEmiRNA和DEmRNA进行Kaplan-Meier生存分析,以获得与CCA患者的预后密切相关的RNA。将26个DElncRNA,3个DEmiRNA和13个DEmRNA经鉴定为与总体存活相关的RNA。其中,17个DElncRNA,2个DEmiRNA和7个DEmRNA表现出保护功能,因为具有较高表达水平的这些RNA患者的预后比具有较低表达水平...
德孚医药出版社在炎症研究期刊发表了最新文章LPS 诱导的急性肺损伤中与焦亡相关的 LncRNA-mRNA 表达谱和 CeRNA 网络综合分析。 内容摘要 目的: 探讨LPS 诱导的急性肺损伤(ALI)基因表达谱中与焦亡相关候选的 lncRNA 和 mRNA 并探讨...
1、用在线工具,比如StarBase,做lncRNA和miRNA的比对,这一步是构建ceRNA的关键。这里494个差异lncRNA和74个差异miRNA进行比对。得到39个DElncRNA和18DEmiRNA相互作用。 2、miRNA靶基因预测 利用TargetScan、miRDB、miRanda、miRTarBase在线工具对18个miRNA进行靶基因预测,得到的靶基因在去和差异基因做淘汰,得到69个靶基因...
LncRNA/miRNA/mRNA 网络在调控卵巢生理功能和卵巢生殖功能障碍性疾病的发生、发展中起重要作用，有望成为治疗生殖障碍性疾病的新靶点和诊断指标。[关键词]长链非编码RNA ；竞争性内源RNA ；卵巢功能 Research progress in lncRNA and its action as ceRNA in ovarian function as well as the relevant diseases LI ...
首先ceRNA不能单纯的以某种RNA来看，比如，某miRNA可以同时靶向两个及以上的mRNA 3'UTR时，改变其中任何...
显然,有了ceRNA的保驾护航,lncRNA研究才能如履平地。 而在ceRNA这种基因表达调控模式种,lncRNA因也存在与mRNA类似的miRNAs反应元件(MREs),可竞争性结合miRNA以达到调节mRNA水平的目的。一般当ceRNA表达沉默时,mRNA则在miRNA介导的沉默复合体(RISC)作用下降解;而当ceRNA表达激活后,可竞争结合RISC复合物,降低miRNA抑制功...