今年5月,浙江大学医学院附属邵逸夫医院章仲恒教授团队综合单细胞RNA-seq和BulkRNA-seq分析探索了UTI对脓毒症的潜在机制。该研究结果已以论文《Integrated Single Cell and Bulk RNA-Seq Analysis Revealed Immunomodulatory Effects of Uli...
双剑合璧scRNA-seq与bulkRNA-seq联合分析 Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而bulk测序代表一群细胞(a population of cells)。我们都知道单细胞转录组测序能够解决常规转录组测序无法解决的细胞异质性问题,对于推进医学和生物学研究进展具有极大的促进作用。现在...
现在很多的研究同时进行Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq,为了明确单细胞测序分析结果的准确性,可以利用相同样本的 Bulk RNA-Seq 数据进行评估,两种测序结果相互印证。 Part .01 2019年10月,美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Transcriptional Basis of Mouse and Human Dendriti...
文章应用：Integrated single-cell RNA-seq analysis identifies immune heterogeneity associated with KRAS/TP53 mutation status and tumor-sideness in colorectal cancers.中文题目：综合单细胞RNA-seq分析确定了结肠直肠癌中KRAS/TP53突变状态和肿瘤侧性相关的免疫异质性 期刊：Frontiers in ImmunologyIF：8.786 样本...
Bulk RNA-seq 和single cell RNA-seq的最主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而bulk测序代表一群细胞(a population of cells)。我们都知道单细胞转录组测序能够解决常规转录组测序无法解决的细胞异质性问题,对于推进医学和生物学研究进展具有极大的促进作用。现在很多的研究同时进行Bulk RNA-seq 和single...
写在前面今天给大家介绍的就是这篇发表在《 Frontiers in Genetics》上题为"Integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing reveals the interaction of PKP1 and tumor-infiltrating B cells a…
Integration of our bulk RNA-seq with single-cell RNA-seq data from pediatric thymus samples30 confirmed that our subsets reflect the continuum of human postnatal T cell development and revealed with high confidence that most thymocytes are represented by our bulk subsets。结果内容的这里提到了单细胞...
scDEAL突出了以下几个方面:(i)它可以使用来自癌症药物敏感性基因组学(GDSC)数据库和癌细胞系百科全书(CCLE)的大量bulk RNA-seq药物反应信息来训练和优化模型;(ii)为了考虑bulk数据和scRNA-seq数据之间的数据结构差异,scDEAL协调单细胞和bulk数据的嵌入,以确保药物反应标签可从bulk数据转移到单细胞数据;(iii)为了...
Bulk RNA-seq 和 single cell RNA-seq 的主要区别在于单细胞测序代表单个细胞(single cell),而 bulk 测序代表一群细胞(a population of cells)。我们都知道单细胞转录组测序能够解决常规转录组测序无法解决的细胞异质性问题,对于推进医学和生物学研究进展具有极大的促进作用。现在很多的研究同时进行 Bulk RNA-seq 和...
1.Bulk RNA-seq(大量RNA-seq)、scRNA-seq、snRNA-seq的区别? (转录组测序即RNA-seq分为bulk、single cell、single nucleus三种测序技术) 传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性。