BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。 E期望值(E-value)这个数值表示你仅仅因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零,发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看,E值越小,比对结果越显著。默认值为10,表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生,如果比对的统计显著性值(E值)小于该值...
BLAST中的E值(E-value)是什么意思? BLAST是指Basic Local Alignment Search Tool,是生物信息学中的一种序列比对算法,用于寻找蛋白质或核酸的相似序列。 下面是一个BLAST结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。 S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度...
对e-value值的by chance 进行解释 最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits ...
BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法，其结果中包含两个关键值：S值与E值。S值反映两序列间的同源性，数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标，它表示在随机情况下，其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此，E值越低，S值的结果越可信。E值的计算公式为...
blast结构的 e-value什么意思一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与...
关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是A.它表示了相应hit的可信度B.它可以大于1C.当它确定的时候,相应的p-value也是确定的D.它和一开始输入
关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是A.它和一开始输入的查询序列的长度有关 ,但和数据库总序列长度无关B.它表示了相应hit的可信度C.当它确定的时候
E-value 也叫做期望值或 E值。E 值越接近零,说明输入序列与当前这条序列为同一条序列的可能性越大。第三部分的表就是根据 E 值由低到高排序的。随着 E 值增大,匹配得分是成反比逐渐降低的。但是一致度与 E 值并非完全成反比。因为我们在前面讲 BLAST 核心思想的时候说过,BLAST 没有做双序列比对,为了提高...
在blast中E值(E-value)是什么?一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值..
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?怎么来理解这个值呢? 下面是一个平常的blast结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。