BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。 E期望值(E-value)这个数值表示你仅仅因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零,发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看,E值越小,比对结果越显着。默认值为10,表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生,如果比对的统计显着性值(E值)小于该...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于这条显示...
对e-value值的by chance 进行解释 最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits ...
BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法，其结果中包含两个关键值：S值与E值。S值反映两序列间的同源性，数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标，它表示在随机情况下，其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此，E值越低，S值的结果越可信。E值的计算公式为...
E-value是一个衡量比对结果的期望随机发生次数的指标。它表示在进行大量随机比对的情况下,期望得到与查询序列的比对相似性至少一样好(或更好)的结果的次数。 较小的E-value表示比对结果的相似性更显著和显著。通常,E-value小于某个预设的阈值(例如0.001或0.05)被认为是显著的比对结果。在BLAST输出中,E-value一般以...
E value：是期望值或E值，表示当在一个特定大小的数据库中搜索时，我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值，如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索，我们期望还能找到1条与本序列得分相同或十分相近的序列。E值越接近0，表明该条目得分的显著性就越高，就越有可能与...
E-value 也叫做期望值或 E值。E 值越接近零,说明输入序列与当前这条序列为同一条序列的可能性越大。第三部分的表就是根据 E 值由低到高排序的。随着 E 值增大,匹配得分是成反比逐渐降低的。但是一致度与 E 值并非完全成反比。因为我们在前面讲 BLAST 核心思想的时候说过,BLAST 没有做双序列比对,为了提高...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢? S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。 E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于这条...
在数学上e用来表示科学计数法如321018记作32e18即eexponent指数结果一 题目 在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 答案 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂相关推荐 1在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04...
blast序列比对中E值是什么意思? E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco... E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。