用Autodock做分子对接需要先准备蛋白和小分子的3的结构文件,并且生成Autodock接受的pdbqt格式。这个视频介绍了不同情况下如何用AutoDockTools生成pdbqt文件,还有怎么用openbabel转换结构文件的格式。 知识 野生技能协会 生物 野生技术协会 科研 生物信息 分子对接 ...
通过比较这些不同菌种来源的NDO与PAHs的对接结果,寻找影响其相互作用的关键氨基酸。实验结论如下:通过同源模建及模型评价,发现工具Phyre2获得的模型质量相对较好;使用Autodock Tools(ADT)将模型与PAHs进行对接后获得了不同来源NDO与PAHs相互作用的特征曲线,PAHs环数的多少会显著影响NDO与PAHs的结合能力;通过对对接结果的...
1.3 蛋白质和蛋白质结构数据库 1.3.1 蛋白质结构数据库 ⑴PDB( www.rcsb.org/pdb/home/home.do) 蛋白质结构数据库 PDB 是世界唯一的生物大分子 3D 结构数据仓库,包含蛋白质 和核算。这些生物大分子是在所有生物中发现的,包括细菌,酵母,植物其他动物和人。 理解一个分子的结构有助于理解它是怎样工作的。这些...
系统标签: autodock 蛋白质 底物 对接 pahs 建模 蛋白质3D建模-酶与底物分子模拟对接-autodock 文档信息主题:关于“高等教育”中“生物学”的参考范文。属性:Doc-94XVNV,doc格式,正文30960字。质优实惠,欢迎下载!适用:作为内容写作的参考文案,解决如何写作、正确编写文案格式、内容摘取等相关工作。目录目录...1 ...
autodock软件已下载安装好，只是不知道做分子对接的具体流程。有哪位能帮忙推荐下相关视频或文档，不胜...
用Autodock做BSA与药物的分子对接 能不能手动调节某个参数，然后使得药物对接完成后，可显示的药物与牛...
用Autodock做分子对接需要先准备蛋白和小分子的3的结构文件,并且生成Autodock接受的pdbqt格式。这个视频介绍了不同情况下如何用AutoDockTools生成pdbqt文件,还有怎么用openbabel转换结构文件的格式。知识分享官 知识 野生技能协会 生物 野生技术协会 科研 经验分享 生物信息 分子对接 autodock 跨年总动员...
通过比较这些不同菌种来源的NDO与PAHs的对接结果,寻找影响其相互作用的关键氨基酸。实验结论如下:通过同源模建及模型评价,发现工具Phyre2获得的模型质量相对较好;使用Autodock Tools(ADT)将模型与PAHs进行对接后获得了不同来源NDO与PAHs相互作用的特征曲线,PAHs环数的多少会显著影响NDO与PAHs的结合能力;通过对对接结果的...
萘双加氧酶与多环芳烃相互作用分子模拟I大连理工大学本科生毕业设计论文萘双加氧酶与多环芳烃相互作用分子模拟Molecular simulation of the interaction of naphthalene dioxygenase a
如题