首先，他们纯化了来自IS21家族成员的IS5376的已知对AAA+活性重要的ATPase突变体（如Walker A (WA), Walker B (WB), arginine finger (RF) 和 sensor II），然后测定了它们的整合活性。和之前的研究一致，结果显示IstB对于链转移是必需的，但IstB ATPase突变体仍然有整合活性（图3c）。接下来他们想要进一步定义...
首先,他们纯化了来自IS21家族成员的IS5376的已知对AAA+活性重要的ATPase突变体(如Walker A (WA), Walker B (WB), arginine finger (RF) 和 sensor II),然后测定了它们的整合活性。和之前的研究一致,结果显示IstB对于链转移是必需的,但IstB ATPase突变体仍然有整合活性(图3c)。 接下来他们想要进一步定义核苷酸...
广泛存在于各种生物体中，其共同特征是包含一个称为 AAA 模块的 AAA 域。该 AAA 模块参与 ATP 结合和水解，通常包含约200-250个氨基酸残基，其中有两个保守的 motif 即 Walker A (GX4GKT) 和 Walker B (HyDE)。除了 ATPase 域本身关键残基的变化，它们功能差异还受到不同附属结构域或因子以及寡...
作者通过计算设计恢复了海氏肠球菌V1-ATPase的B亚基中伪活性位点失去的ATP结合能力,从而验证他们的假设。 图1.蛋白质复合物中别构位点的设计策略。(a)蛋白质二聚体中别构位点的设计策略。(b)海氏肠球菌V1-ATPase中别构位点的设计。 A亚基的活性位点有著名的loop motif,通常称为Walker-A motif或P-loop,用于和AT...
这一域参与ATP的结合和水解，通常含有约200至250个氨基酸残基，其中包含两个保守的motif，即Walker A (GX4GKT) 和 Walker B (HyDE)。它们的功能差异不仅源自ATPase域关键残基的变化，部分还来自于它们不同的附属结构域或因子，以及它们寡聚状态的可变组织。
图1.蛋白质复合物中别构位点的设计策略。(a)蛋白质二聚体中别构位点的设计策略。(b)海氏肠球菌V1-ATPase中别构位点的设计。 A亚基的活性位点有著名的loop motif,通常称为Walker-A motif或P-loop,用于和ATP的磷酸基团结合。然而,B亚基的伪活性位点没有P-loop,而是一个伪P-loop。伪P-loop的氨基酸序列和主链...
V_ATPase分子结构与功能及其RNAi技术在害虫防治中的应用研究进展
2009. Walker-A threonine couples nucleotide occupancy with the chaperone activity of the AAA+ ATPase ClpB. Protein Sci. 18:287-293. doi: 10.1002/pro.36. 142. Naismith, T. V., J. E. Heuser, X. O. Breakefield, and P. I. Hanson. 2004. TorsinA in the nuclear envelope. Proc. Natl...
The nucleotide-binding site has several characteristic signature motifs, including P-loop, Walker-A and -B, and sensors-1 and −25. Typically, AAA + ATPases form hexameric ring or double-ring structures, in which neighboring subunits act as activators for ATP hydrolysis involving a ...
Walker, J. E., Saraste, M., Runswick, M. J. & Gay, N. J. Distantly related sequences in the alpha- and beta-subunits of ATP synthase, myosin, kinases and other ATP-requiring enzymes and a common nucleotide binding fold. EMBO J. 1, 945–951 (1982). Article CAS PubMed PubMed ...