目前单细胞测序技术在表观遗传组学领域主要用于三个方面:一是单细胞hic技术,基于gpc甲基化水平的核小体定位技术(nome-seq);二是用来测量dna甲基化程度的简化代表性亚硫酸氢盐测序法(rrbs-seq);三是全基因组甲基化测序的方法。2015年,buenrostro等人发表了单细胞atac-seq技术(scatac-seq),一种对转座酶易感的染色质...
摘要 本发明公开了一种大批量单细胞ATAC‑seq数据质量控制和分析方法,其特征在于,包括以下步骤:第一步、原始测序文件的FASTQ格式或者比对完的SAM/BAM格式作为输入文件;第二步、测序片段水平和多细胞水平的质量控制;第三步、单个细胞层面的质量控制;第四步、细胞聚类和细胞特异峰的探测:第五步、给用户提供一份质量...
本发明公开了一种大批量单细胞ATAC‑seq数据质量控制和分析方法,其特征在于,包括以下步骤:第一步、原始测序文件的FASTQ格式或者比对完的SAM/BAM格式作为输入文件;第二步、测序片段水平和多细胞水平的质量控制;第三步、单个细胞层面的质量控制;第四步、细胞聚类和细胞特异峰的探测:第五步、给用户提供一份质量控制的...