ATAC-seq与ChIP-seq | ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing。用于研究染色质可及性/开放性的方法。 ChIP-Seq原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing)是一种用于研究细胞基因组上所有DNA转座子的测序技术。在ATAC-seq实验中,使用Tn5 transposon酶对细胞的染色质进行切割,产生许多短的DNA片段。为了将这些短片断有效地输送到Next Generation Sequencer进行分析,通常需要将它们聚合到一起以形成较长的片...