ATAC-seq是一种创新的表观遗传学研究技术,该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。 染色体主要由DNA和蛋白质组成,每一条染色单体由单个线性DNA分子组成,细胞核中的DNA是经过高度有序的包装,包装分为多个水平,核小体核心颗粒(nucleosome ...
单细胞ATAC-Seq(scATAC-Seq) 如何在研究中开始使用ATAC-Seq 总结:ATAC-Seq改变了表观遗传学的研究方式 ATAC技术轻松get!ATAC-Seq完整解决方案 染色质免疫沉淀(ChIP)和RRBS等方法使研究人员更容易在全基因组范围内研究表观遗传修饰。但是,这些方法的潜在局限性之一是您需要对什么表观遗传学机制在其中起作用有初步的...
ATAC-seq 是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,获得在该时空下基因组中所有活跃转录的调控序列,再通过聚类分析,挖掘这些开放位点的潜在结合转录因子,结合基因表达水平数据,发现关键的调控转录因子。 ATAC...
ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing,中文可理解为结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。这个方法是2013年由斯坦福大学的William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室共同开发的用于研究染色质可及性/开放性的方法。目前,通过ATAC-seq方法发表的文章数量...
ChIP 测序，也称为 ChIP-seq，是一种对特定组蛋白修饰、DNA 修饰或 TF 的位置进行检测的全基因组分析...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法, 其原理是利用转座酶Tn5容易结合在开放染色质的特性,将转座DNA设计为接头,随机插入染色质的开放...
ATAC-Seq与ChIP-Seq的不同的是ATAC-Seq是全基因组范围内检测染色质的开放程度，可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息，一般用于不知道特定的转录因子，用此方法与其他方法结合筛查感兴趣的特定调控因子；但是ChIP-Seq是明确知道感兴趣的转录因子是什么，根据感兴趣的转录因子设计抗体去做ChIP实验拉DNA，...
ATAC-seq被广泛应用于解析基因组中转座酶易接触位点，并以此绘制染色质开放图谱，预测TF结合位点，展现...
ATAC-seq，全名为Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing，是由美国斯坦福大学的William Greenleaf教授于2013年所研发的全新表观遗传学研究方法。通过利用DNA转座酶结合高通量测序技术，该技术旨在研究染色体的可及性，揭示基因组中所有活跃转录的调控序列。ATAC-seq技术的创新...
ATAC-seq，全称"Assay for Targeting Accessible Chromatin with high-throughput sequencing"，是一种高通量测序技术，用于揭示染色质区域的调控因子结合位点，以及转录因子对核小体位置的影响。其核心原理是利用活性的Tn5转座酶在开放染色质区域（OCR）插入测序接头，然后进行测序，从而推断可接近性区域的特征...