(3)1/4荧光强度差加上最小荧光强度,得到下荧光;1/3荧光强度差加上最小荧光,得到上荧光; (4)计算下荧光及下荧光对应的循环数。 17. 将剩余步骤9中的45 ul PCR产物放回PCR仪中继续反应: PCR程序: 18. 用Qiagen MinElute PCR纯化试剂盒纯化扩增文库;使用20μl EB洗脱。 19. 凝胶分离和纯化: 将纯化后的...
(3)1/4荧光强度差加上最小荧光强度,得到下荧光;1/3荧光强度差加上最小荧光,得到上荧光; (4)计算下荧光及下荧光对应的循环数。 17. 将剩余步骤9中的45 ul PCR产物放回PCR仪中继续反应: PCR程序: 18. 用Qiagen MinElute PCR纯化试剂盒纯化扩增文库;使用20μl EB洗脱。 19. 凝胶分离和纯化: 将纯化后的...
The Omni-ATAC protocol enables chromatin accessibility profiling from material that was previously deemed intractable including frozen tissue samples.doi:10.1038/protex.2017.096M. Ryan CorcesAlexandro E. TrevinoEmily G. HamiltonPeyton G. Greenside
Figure 2: Schematic overview of ATAC-seq protocol 与其他技术比较 现有的用于绘制DNA调控元件的技术种类繁多,在特定应用中选择最适当且信息量最大的技术变得具有挑战性。在下表中,作者比较了用于绘制DNA调控元件的最常用技术的一些技术和实验方面:ATAC-seq、DNase-seq、MNase-seq、ChIP-seq和靶向CUT&TAG,以帮助新...
铛铛铛铛,冻存样本处理protocol放送了! (Tips:细胞冻存或者组织冻存时,建议放在液氮中保存,这样样本存储时间更久,得到的结果更好哦!) 01、冻存细胞预处理 1.1实验前准备 1.在开始细胞解冻前,将水浴锅设置为37℃; 2.准备约50 mL温热(37℃预热)的RPMI-1640 +10%FBS培养基; ...
Figure 2: Schematic overview of ATAC-seq protocol 与其他技术比较 现有的用于绘制DNA调控元件的技术种类繁多,在特定应用中选择最适当且信息量最大的技术变得具有挑战性。在下表中,作者比较了用于绘制DNA调控元件的最常用技术的一些技术和实验方面:ATAC-seq、DNase-seq、MNase-seq、ChIP-seq和靶向CUT&TAG,以帮助新...
The optimized protocol guides you through the steps for sample preparation, tagmentation and library preparation, yielding next-gen sequencing-ready libraries that can be multiplexed in a single flow cell sequencing run. ATAC-Seq Kit Highlights: Reveal the genomic sequence of open chromatin regions ...
The optimized protocol guides you through the steps for sample preparation, tagmentation and library preparation, yielding next-gen sequencing-ready libraries that can be multiplexed in a single flow cell sequencing run. ATAC-Seq Kit Highlights: Reveal the genomic sequence of open chromatin regions ...
Generalized ATAC-seq library preparation protocol 数据分析流程 1、比对, 去接头, 和去除线粒体 reads 2、reads 去重复 3、生成信号轨迹图 4、Peak Calling 5、下游分析 ATAC-seq general workflow 非常详细的 ATAC-seq 数据分析指导资源 Title and author Notes link ATAC-seq data analysis: from FASTQ to ...
样本:从单细胞悬浮液抽提细胞核,可参考细胞核抽提protocol制备细胞核悬液。 图4 10x Genomics 单细胞ATAC送样建议 应用方向 研究领域应用范围广——干细胞、发育分化、肿瘤、免疫、神经系统等。 分析内容 基于染色质开放区域和转录因子motif富集进行细胞的分群和鉴定; ...