王华锋教授点评 尽管单细胞测序(scRNA-seq)和免疫荧光技术已经明确了AML的骨髓微环境异质性,并提出了LSCs的关键作用,但在血液疾病中,骨髓的空间转录组分析仍然是一个巨大的挑战。我们提出了一种基于脱钙的骨髓空转新方法——SPOT-seq,...
RNA 测序用于检测基因表达水平和基因融合事件,而 scRNA-seq 用于分析单个细胞的转录组信息。 关键作用: RNA 测序检测到了多种已知的驱动融合基因,如 PML::RARA 等,并且能够评估驱动突变基因的表达丰度,这对于预测新抗原的呈递和免疫原性至关重要。 scRNA-seq能够发现 AML 微环境中的免疫细胞亚群和状态,如耗竭 CD8 ...
王华锋教授点评 尽管单细胞测序(scRNA-seq)和免疫荧光技术已经明确了AML的骨髓微环境异质性,并提出了LSCs的关键作用,但在血液疾病中,骨髓的空间转录组分析仍然是一个巨大的挑战。我们提出了一种基于脱钙的骨髓空转新方法——SPOT-seq,...
接着,利用单变量和 LASSO Cox 回归分析,构建了 ICDRS 模型,这就好比搭建了一座桥梁,将基因数据和 AML 的预后联系起来。还运用了单细胞 RNA 测序(scRNA - seq)技术,深入研究 AML 骨髓微环境,就像用显微镜观察微观世界一样,让研究人员看到了细胞层面的奥秘。 下面我们来看看具体的研究结果: 1. ICD 风险特征的开...
AML中细胞层次以不同方式扭曲,这取决于它们基因改变和细胞起源。每个患者白血病细胞组成可能反映了疾病LSCs上特定突变的功能后果。因此,对白血病层次的探究可能为整合AML遗传和干细胞模型提供了一个潜在机会。单细胞RNA测序(Single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)已成为解剖细胞层次结构的有力工具。
安德森癌症中心结合scRNA和scTCR揭示了AML 相关T细胞亚群的异质性 急性骨髓性白血病(Acute myeloid leukemia, AML),是一种骨髓性白细胞异常增殖的血癌,是成年人最常见的急性白血病,其发病率随着人的年龄而增加。与通过T细胞活性异体干细胞移植对急性骨髓性白血病的治疗效果相比,检查点阻断疗法只能获得适度的反应,这可能...
尽管单细胞测序(scRNA-seq)和免疫荧光技术已经明确了AML的骨髓微环境异质性,并提出了LSCs的关键作用,但在血液疾病中,骨髓的空间转录组分析仍然是一个巨大的挑战。我们提出了一种基于脱钙的骨髓空转新方法——SPOT-seq,可以在保证mRNA完整性的前提下提供AML患者骨髓的空间转录组图谱。SPOT-seq方法整合了空间转录组学、...
(scRNA-seq) enabels the examination of cell-specific gene expression patterns, their microenvironment, and their dynamic interactions, providing insights into tumor biology and heterogeneity, stress responses, treatment resistance, and biomarker identification (Zou et al.2023; Shuang Geng1 et al..2019...
✧为了评价1例注射aAVC-WT1后白血病细胞生长明显减少的患者的BM和PB中T细胞的基因特征，研究人员使用单细胞RNA测序(scRNAseq)对该例病人的一些标志物基因进行了跟踪分析。在BM中，诸如细胞毒性打分、增殖标志物和IFN反应标志物等效应标志物均增加。相比于PB中的T细胞，BM中的细胞毒性相关分子（GZMA, GZMB, GZMH, ...
(scRNA-seq) enabels the examination of cell-specific gene expression patterns, their microenvironment, and their dynamic interactions, providing insights into tumor biology and heterogeneity, stress responses, treatment resistance, and biomarker identification (Zou et al.2023; Shuang Geng1 et al..2019...