本研究中,我们采用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)对儿童AML患者的骨髓样本进行分析,这些样本分别来自诊断(Dx)、诱导治疗结束(EOI)和复发阶段。通过对Dx和EOI阶段的scRNA-seq数据以及TARGET AML项目的RNA-seq数据集进行深入分析,我们识别出7个与AML细胞密切相关的基因:CLEC11A、PRAME、AZU1、NREP、ARMH1、C1QBP和TRH...
因此,我们获得了第二个公开可用的scRNA-seq数据集,其中包含另外5个具有AML39的个体(扩展数据图2c)。 为了交叉验证我们的计算目标识别方法,我们使用了scANVI,一种半监督变分autoencoder,将Petti等人生成的参考图映射到一个新的参考图中(扩展数据图2e)。 综上所述,CSF1R和CD86在恶性造血细胞中比在健康造血细胞中优...
因此,我们获得了第二个公开可用的scRNA-seq数据集,其中包含另外5个具有AML39的个体(扩展数据图2c)。 为了交叉验证我们的计算目标识别方法,我们使用了scANVI,一种半监督变分autoencoder,将Petti等人生成的参考图映射到一个新的参考图中(扩展数据图2e)。 综上所述,CSF1R和CD86在恶性造血细胞中比在健康造血细胞中优...
最后研究者分析了几个急性髓系白血病(AML)患者的骨髓样本,通过PCF空间单细胞蛋白组发现了AML患者样本中髓系细胞显著增多,细胞邻域分析揭示了小动脉-骨内膜区域中恶性细胞和MSC细胞产生互作,这个空间生态位对于治疗耐受非常关键。 总结与讨论 本研究联合scRNA-seq和空间单细胞蛋白组深度解析了骨髓微环境。特别是空间单细胞...
最后研究者分析了几个急性髓系白血病(AML)患者的骨髓样本,通过PCF空间单细胞蛋白组发现了AML患者样本中髓系细胞显著增多,细胞邻域分析揭示了小动脉-骨内膜区域中恶性细胞和MSC细胞产生互作,这个空间生态位对于治疗耐受非常关键。 总结与讨论 本研究联合scRNA-seq和空间单细胞蛋白组深度解析了骨髓微环境。特别是空间单细胞...
使用 scRNAseq 鉴定的 AML 细胞比例与通过临床流式细胞术(r=0.87,p=1.5×10-7)和组织病理学(r=0.73,p=0.0001)测量的原始细胞比例密切相关(图 1F)。治疗前和治疗后的AML细胞按患者聚集(图 1G),而来自不同患者的TME聚集在一起并具...
最后研究者分析了几个急性髓系白血病(AML)患者的骨髓样本,通过PCF空间单细胞蛋白组发现了AML患者样本中髓系细胞显著增多,细胞邻域分析揭示了小动脉-骨内膜区域中恶性细胞和MSC细胞产生互作,这个空间生态位对于治疗耐受非常关键。 总结与讨论 本研究联合scRNA-seq和空间单细胞蛋白组深度解析了骨髓微环境。特别是空间单细胞...
使用 scRNAseq 鉴定的 AML 细胞比例与通过临床流式细胞术(r=0.87,p=1.5×10-7)和组织病理学(r=0.73,p=0.0001)测量的原始细胞比例密切相关(图 1F)。治疗前和治疗后的AML细胞按患者聚集(图 1G),而来自不同患者的TME聚集在一起并具有不同的分布(图 1H,I)。AML和TME细胞的聚集模式与其他显示肿瘤间异质性的...
内容概要:使用scRNA-seq技术,发现急性髓系白血病(acute myeloid leukaemia,AML)患者的T细胞、NK细胞、单核细胞、树突状细胞(dendritic cells,DCs)和造血干细胞祖细胞(haematopoietic stem cell progenitors,HSC-Prog)的亚群簇多样性存在显著差异。NK细胞和单核细胞-DCs在转录因子表达和染色体拷贝数变异(chromosome copy numb...
scRNAseq-AML:急性髓细胞白血病数据集的单细胞分析 行业研究 - 数据集心愁**rⅡ 上传4.68 KB 文件格式 zip R scRNAseq-AML 急性髓细胞白血病数据集的单细胞分析点赞(0) 踩踩(0) 反馈 所需:11 积分 电信网络下载 choosealicense.com 2025-03-27 10:24:06 积分:1 ...