10x Genomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞,然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构,实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平转录表达信息,并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释,实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的
Read 1 测序引物:测序的“钥匙”,测序引物结合位点。 10x Barcode(16 nt):唯一标识单个细胞,共有约 350万种 不同组合,确保“一细胞一编码”。 UMI(12 nt):随机序列,为每个RNA分子打上“分子身份证”,避免PCR扩增带来的重复计数误差。 poly(dT)反转录引物(30 nt):像“磁铁”一样吸附mRNA的poly-A尾,捕获...
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 10x Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优势,一个样品...
10x Genomics 方案 基于10x Genomics ChromiumTM的单细胞转录组测序 高通量、短周期、低成本 近年来,已有多种单细胞测序技术及平台应用而生, 10x Genomics凭借其高细胞通量、极短项目周期及极低成本脱颖而出。 技术参数 测序策略 Illumina HiSeq PE150
自此,单细胞转录组文库构建完成,接着就该进行illumina测序。 NGS | illumina测序原理简述 参考文章: https://www.10xgenomics.com/cn/support/single-cell-gene-expression/documentation/steps/library-prep/chromium-single-cell-3-reagent-kits-user-guide-v-3-1-chemistry-dual-index ...
10x genomics单囊泡转录组测序 图a:单囊泡的捕获以及测序,分析路线 这里有个实验技术重点:单个囊泡的捕获和测序。 单个囊泡的大小在100nm-1000nm级别,这个大小是比常规的单个细胞要小非常多的,打个比方:一个细胞体积约等于10^6个外泌体 思考:那10x genomics技术在这里形成油包水结构的时候,双包体/多胞体会出...
项目名称:10x Genomics单细胞转录组测序技术服务 项目负责人:赵宇 项目负责人所在单位:四川大学华西医院耳鼻咽喉-头颈外科 二、外协信息 外协单位:杭州联川生物技术股份有限公司 外协经费:1.2万元 任务内容:组织样品的10x Genomics单细胞转录组细胞标记和文库构建、测序 ...
1、10x单细胞转录组测序实验方案 测序策略:Illumina平台PE150 数据量与捕获的细胞数量相关,捕获细胞越多,产生的数据量也越多,具体如下: 2、单细胞转录组测序技术优势 (1)精准分选:利用10x Genomics平台,实现真正的单细胞测序; (2)细胞捕获率高达65%,可实现大量单细胞的快速高效标记、测序和分析; ...
■ 通量高一次可以同时测8个样本,每个样本最多可以检测到上万个细胞■ 周期短17分钟内完成上万个细胞封装一天之内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库■ 捕获效率高细胞捕获效率高达65 %■ 应用范围广动物细胞和植物细胞均可以进行单细胞测序已广泛应用于肿瘤细胞
差不多几个小时就可以完成全部的样品的cellranger的定量流程。但是很多时候,大家是 从公共数据库下载的10x技术单细胞转录组测序数据,而不是自己的测序仪产出的数据,就容易出现 比如:https://kb.10xgenomics.com/hc/en-us/articles/115003802691-How-do-I-prepare-Sequence-Read-Archive-SRA-data-from-NCBI-for-Cel...