在过去几年里,我们注意到单细胞技术取得了很多进展,这要归功于10x Genomics。这种多组学方法对科学家和医生了解人类疾病特别有用。 David Michonneau博士 法国圣路易医院血液学教授 提升您的研究成果 通过出色的多组学整合和40多种示范方案,实现市场上最广泛的应用。
10X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术公司,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC,简而言之可以理解为从mRNA捕获到下机的一整套流程,是目前最常用的技术。 10X Genomics Workflow 1、了解Gel beads(凝胶微珠) Gel bead...
10x Genomics Chromium GEM-X单细胞解决方案,是基于Chromium X系列仪器,将单细胞基因表达(3’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Gene Expression v4,将单细胞免疫组(5’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Immune Profiling v3,此次试剂的升级,将大幅提升单细胞检测的性能,助力拓展肿瘤、免疫、发育、疾病等...
10X Chromium Single Cell Gene Expression Solution平台的通量高、周期快速、成本低、细胞捕获效率高、性能优势比较明显，并且商业化仪器操作简便；BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System作为更为开放的定制化平台，以及转录组测序与蛋白同时检测的平台，具有检测信息更完善、成本更低的优势，二者均广泛的应用于发育与...
10X Genomics凝胶微珠设计 与其他大规模单细胞分选平台相比,通量高、周期快速、成本低、细胞捕获效率高,并且商业化仪器操作简便。但对细胞活性要求较高,大于90%。 4.BD Rhapsody BD的基本技术原理:1个微孔=1个单细胞=1个磁珠=1个RNA-Seq。 BD的Rhapsody平台,最早可以追溯到2015年Single Cell Cytoseq技术,可以说...
作为单细胞测序的一个重要里程碑,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,此平台整合了仪器、试剂盒和信息学软件,能全面对接illumina测序仪,因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大...
10X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术平台,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC。这篇文章将主要简述10X Genomics在单细胞基因表达检测方面,也就是scRNA-seq上的应用。
10x Genomics单细胞分析在中性粒细胞研究中的应用 尽管中性粒细胞是最常见的白细胞类型之一,并且在先天免疫(吞噬病原体)中发挥着重要作用,但它们仍然是个谜。就多个不同的因素而言,这些细胞在很大程度上存在差异,包括形态、表面标志物以及迁移、吞噬和抑制功能(1)。这使得它们难以被分类。重要的是,鉴定这些细胞亚群...
10x Genomics Chromium,单细胞研究领域的一匹黑马,自从其Single Cell Gene Expression Solution发布以来,一直深受科研人员的关注。 10x Genomics打破传统的单细胞技术限制,采用「微流控芯片」对细胞进行精确区分,通过10x Barcodes标记每一个细胞,能实现大规模的单细胞转录组测序,在细胞异质性研究中表现出色。
将构建好的文件作为输入文件,运行 cellranger mkref 添加标记基因的参考基因组就构建好了。 参考资料: https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/using/tutorial_mr#marker 文案| 刘静 封面配图源于网络 侵删