3'-Digital Gene Expression(3'-DGE)RNA-Seq是一种相对较新的 RNA 测序方法。它靶向每个转录本的3'-末端,并针对这种差异基因表达项目进行了优化。3'-Digital Gene Expression中的"digital"指的是计数,这种RNA测序方法有时也被称为 "转录本计数法"。 FT RNA-Seq与3'-DGE RNA-Seq 传统的FT RNA-Seq在cDNA...
RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
☆ RNA-seq的生物信息分析 一、深度测序数据获取 和EBI、DDBJ组成INSDC,数据内容相同所以找NCBI就行。 (一)NCBI常用数据库 GenBank:遗传序列数据库,收集了所有公开的DNA序列及其注释 GEO (Gene Expression Omnibus) :收集整理各种表达芯片数据,后来加入了甲基化、lncRNA、miRNA、CNV等其他芯片,还有高通量测序数据。文...
瞒不住了!高通量单细胞RNA-Seq,长读长的那种! 在有些研究场景下,长读长测序(long-read sequencing)方法相比传统的短读长测序(short-read sequencing)方法,会是一个更好的选择。长读长测序文库构建操作相对简便。需要多次重复构建文库时,长读长测序也不需面对短读长测序那样复杂繁琐的操作流程。此外,长读长测序...
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学，由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平（GEL）的测量，GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用，但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
根内生真菌与多种陆生植物建立互利关系,如Piriformospora indica(梨形孢菌,P. indica ),作用于缓解作物的盐胁迫,并通过促进生长、抗病性和抗逆性使寄主植物受益。 观察到从耐盐菌中分离的特定基因的异源表达,例如Debaryomyces hansenii 和 Aspergillus glaucus 显着提高了酿酒酵母、拟南芥和烟草的耐盐性。 研究表明,P...
RNA-Seq简介 举个例子,现在我们有一群正常的神经细胞,一群突变的神经细胞,突变细胞的行为与正常细胞不同。我们想知道是什么遗传机制造成了这种差异,这意味着我们想要观察基因表达的差异。每一个细胞有一堆染色体(chromosomes),每一个染色体上有一堆基因,有一些基因是活跃的,有的是不活跃的,高通量测序告诉我们哪些基...
近日,浙江大学郭国骥、梁廷波等研究人员在权威期刊Advanced Science上发表了题为“Pan-Cancer Single-Nucleus Total RNA Sequencing Using snHH-Seq”的研究论文,本研究中,研究人员开发了一种高通量、高灵敏度的方法snHH-seq,该方法将随机引物与液滴微流控平台的预索引策略相结合。这种创新的方法允许从临床冷冻样品中...