RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
RNA RNA高通量测序基于第二代测序技术,主要有Illumina(Solexa)测序和Ion Torrent测序两种常用的方法。这两种方法都是通过将RNA分子转录成cDNA,然后进行文库构建,最后使用测序技术对文库进行高通量测序。具体来说,RNA高通量测序方法主要包括以下几个步骤: 1.提取RNA:首先需要从细胞或组织中提取RNA分子。常见的RNA提取方法...
由于缺乏区分m6A与A的化学方法, 使用m6A特异性抗体预富集含m6A的RNA片段结合高通量测序可实现对m6A的特异性检测。 2012年,康奈尔大学医学院的Jaffrey课题组和以色列特拉维夫大学的Rechavi课题组基于m6A特异性抗体结合高通量测序技术建立了m6A免疫沉淀测序方法 (m6A-specific methyled RNA immunoprecipitation coupled with nex...
导读:肿瘤异质性及其驱动因素影响肿瘤进展和癌症治疗。单细胞RNA测序用于研究肿瘤生态系统的异质性。 近日,浙江大学郭国骥、梁廷波等研究人员在权威期刊《Advanced Science》上发表了题为“Pan-Cancer Single-Nucleus Total RNA Sequencing Using snHH-Seq”的研究论文,本研究中,研究人员开发了一种高通量、高灵敏度的方法...
HeliScope测序技术 ➢高通量RNA-Seq技术应用及前景 第一代测序技术 1954年,首次利用多聚核糖核苷酸链的降解法实现DNA测序 第一代测序技术主要代表为:sanger法:由于ddNTP的2´和3´都不含羟基,在DNA合成反应中不能形成 磷酸二酯键,因此可以被用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例的...
除了将4200 TapeStation系统广泛应用于高通量测序服务的RNA质控和文库质控等多个环节,生工生物还提供独立的RNA质控服务。用户只需提供RNA样本,生工生物便负责完成质控并出具详细结果。相关服务详情如下:生工生物的高通量测序服务 自2011年成立以来,生工生物工程(上海)股份有限公司持续拓展高通量测序业务,先后引进了包括...
高通量:高通量测序技术能够同时对数百万到数十亿的DNA分子进行测序,这使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能。因此,该技术也被称为深度测序或下一代测序技术。高灵敏度:由于高通量测序技术能够同时检测大量样本,因此可以检测到极低丰度的DNA或RNA序列,从而提高了检测的灵敏度。低成本:相比...
易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应答、癌症发生与发展、药物应答等研究领域;可应用...
高通量测序 lncRNA测序 一、服务介绍 长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)一般是指长度大于200 nt的RNA,位于细胞核内或胞浆中,不参与蛋白质编码功能,以RNA形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达水平,在生命活动中具有重要作用。