RNA高通量测序(RNA-seq)是转录组测序技术的一种,可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析,反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异,以及基因单点突变导致的SNP等。
在过去的十年中,作为一种用于提供高分辨率转录组信息的技术,RNA测序(RNA-Seq)变得越来越流行。转录组是单个细胞或细胞群中所有RNA转录本的集合,转录组数据可以深入揭示从转录调控、细胞分化到致癌作用等的一系列过程。 成功的RNA-Seq首先要制备高质量的RNA文库,其主要步骤是首先将RNA片段化、随后将RNA转化为cDNA、再...
因此,对于一些融合事件、异构体,以及其它结构变异的检测能力得到提升。 本次推送为大家献上一份ICELL8 cx单细胞分选系统用户可以参考的《单细胞长读长测序建库方案》。 基于ICELL8 cx系统的SMART-Seq应用工作流程,将和Oxford Nanopore Technology(ONT)一起奉献一场精彩的表演。 在该建库方案中,以单细胞起始,通过IC...
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性:高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计,例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外,该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合,如ChIP-seq、甲基化测序等,从而进一步扩展了其应用范围。
然而,scRNA-seq在处理临床肿瘤样本,特别是档案材料(如冷冻组织)方面具有独特的后勤和技术挑战。首先,临床肿瘤样本的scRNA-seq需要实施快速组织解离程序,目前大多数医院的常规病理实验室不存在这种程序。其次,大多数scRNA-seq方法使用oligo-dT引物来捕获和扩增聚腺苷化转录本,这一过程高度依赖于组织样品的质量。此外,寡聚...
近日,浙江大学的研究人员开发了一种全新的高通量单核总RNA测序技术snRandom-seq,并成功用于福尔马林固定石蜡包埋(Formalin-fixed paraffin-embedding,FFPE)组织的检测。这种方法具有高准确性和灵敏度,可广泛应用于临床FFPE样本的生物医学研究。 福尔马林固定石蜡包埋是医院保存病理组织最常用的方法,并且也是分子生物学研究中...
HeliScope测序技术 ➢高通量RNA-Seq技术应用及前景 第一代测序技术 1954年,首次利用多聚核糖核苷酸链的降解法实现DNA测序 第一代测序技术主要代表为:sanger法:由于ddNTP的2´和3´都不含羟基,在DNA合成反应中不能形成 磷酸二酯键,因此可以被用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例的...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术已成为揭示单个细胞内RNA转录物异质性和复杂性,以及揭示组织/器官/生物体中不同细胞类型和功能组成的最新方法。自2009年首次运用以来,基于scRNA-seq的研究在不同领域提供了大量信息,在人类、模型动物和植物体内细胞组成和相互作用方面取得了惊人的新发现。 近年来,单细胞测序发表文章也是...
高通量单细胞RNA测序技术(Single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)是一种能够对单个细胞进行RNA测序的先进技术。传统RNA测序技术需要使用大量细胞才能获得足够数量的RNA样本进行分析,这导致了细胞间的异质性被掩盖,无法捕捉到不同细胞之间的差异。而高通量单细胞RNA测序技术则能够破解这一难题,实现对单个细胞的RNA表达谱进...