图1 代谢物和基因的关联网络 转录组+代谢组的多组学分析，可以同时实现从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题，相互间进行验证，从海量的数据中筛选出关键基因、代谢物及代谢通路，深度解析生物系统的宏观发育过程，解释生物过程的复杂性和整体性。二、研究思路 1、样本收集：首先，根据研究目的，选择相应的样本...
下面将分别介绍转录组和代谢组的相关内容。 一、转录组 转录组是指在特定条件下,生物体内全部或某一部分基因被转录成mRNA的总和。转录组研究的主要内容包括基因表达的定量和定性分析、基因功能的预测、转录调控机制的研究等。 1.基因表达的定量和定性分析 转录组研究可以通过高通量测序技术,如RNA-seq,对某一细胞或...
图5 KEGG分析中富集的差异代谢途径 组学联合研究方案 欧易生物不仅提供基因、转录、表观、微生物、蛋白、代谢等全组学检测服务，而且在单细胞测序、空间多组学（空间代谢组、空间转录组、空间蛋白组）、单细胞蛋白组、多组学联合分析等方面亦有非常丰富的项目经验。欢迎有项目意向的老师扫描文末二维码咨询，欧易生物为您...
单细胞+时空多组学,转录组+代谢组关联研究技术顶配 转录组测序和代谢组质谱检测由于分别是基因型和表型研究技术应用的代表,将二者数据关联分析或用来互相验证结果成为很多研究的首选,其研究精度正因单细胞组学和空间组学的出现,得到大幅度提升。科研人员开始陆续使用最前沿的single-cell RNA-seq(scRNA-seq,单细胞转录组)...
一、转录组+代谢组联合分析 转录组和代谢组是两种重要的生物学研究方法,他们分别研究基因转录的mRNA水平和生物体内代谢产物的变化。 转录组是研究功能基因的利器,主要是测定某一时期生物体在特定条件下基因的表达谱,即对RNA进行鉴定和定量,表达谱能反映机体的生理状态,如通过分析差别表达情况,去判定机体癌症相关的病变...
图1 转录组-代谢组关联分析流程图 一、 转录组和代谢组 PCA 比较分析 通过PCA方法，能够观察组内样本的聚集程度和组间样本的总体分布趋势，然后比较不同的组学的分布趋势的异同和变化。利用全部的基因与代谢物进行PCA的绘制。图2 转录组和代谢组的PCA图 注：图中每个点代表一个样本，不同的颜色表示不同的组别；...
WGCNA因可直接整合表达模式相似的基因或代谢物,不仅可构建基因-基因相似性网络,还可结合性状数据与基因相互组合,进而寻找复杂性状的主要影响因素(基因,模块)。正是因其可以结合性状数据,该方法为转录组-代谢组关联分析提供了基础。代谢物作为分子机制的下游,可直接解释表型差异的因素。在关联分析时,将目标代谢物的丰度...
由于分子调控网络组成的复杂性,转录组多组学研究已经成为了深入挖掘分子调控网络和发表高分文章的重要策略之一,其中“转录组+代谢组”关联分析是转录组多组学分析中最为热门的研究方案,文章发表量和相关期刊影响因子一直居高不下。不同的多组学搭配方案能够挖掘出不同的分子调控信息,而“转录组+代谢组”则是将基因表达...
1、单细胞转录组与代谢组的关联思路 无论是单细胞转录组还是代谢组,往往都需要进行组间差异分析,因此将这两个组学进行关联的重点就是寻找差异。将差异基因与差异代谢物进行关联寻找到某个关键通路。通过这个关键通路进一步寻找到关键的细胞亚群、关键基因或关键代谢物,从而解释某种生物学现象就是这2种组学进行关联的最...
一、转录组+代谢组联合分析 转录组和代谢组是两种重要的生物学研究方法,他们分别研究基因转录的mRNA水平和生物体内代谢产物的变化。 转录组是研究功能基因的利器,主要是测定某一时期生物体在特定条件下基因的表达谱,即对RNA进行鉴定和定量,表达谱能反映机体的生理状态,如通过分析差别表达情况,去判定机体癌症相关的病变...