一篇文章教会你怎么玩转组学强强联合——转录组联合代谢组分析 原创 小微 A科研显微镜 关注我们 导读 近年来随着组学技术的快速发展,其成本越来越低,成为科研工作者发文章的利器。但是目前单一组学的文章很多,分析思路也大体相同。在这种环境下想突破重围发高分文章还是比较困难的。因此有些科研工作者就开始着手涉及多组...
由于果皮和果仁是核桃果实最终被吃掉的部分,因此作者还找到了果皮或果仁的特定代谢物。 图2 不同核桃果实样品中含量最高的代谢物 3.核桃果实动态转录组的特征 作者利用qRT-PCR对转录组数据进行了验证,通过WGCNA将差异表达基因分配到13个共...
5、转录组、代谢组和抗炎指数相关性分析 作者进一步通过对谷子籽粒灌浆中期转录本丰度、代谢物含量和抗炎指数之间的相关性分析,构建转录组、代谢组和抗炎特性之间的网络关系(图5)。在代谢-转录网络中共包含了9415对基因-代谢物,其中大多数基因来自与维生素B6和硫胺素代谢相关的“棕色”共表达模块(图5A)。利用套索回归...
2、代谢组:鉴定菌株在降解目标有机物时的中间产物,在对该有机物的生化反应有充分了解的基础上,可初步推测该菌株的生物降解途径; 3、基因组:一方面提供该菌株的基因组组装和注释信息,作为转录组分析的参考基因组;一方面也可与已知基因组的类似菌株联合进行比较基因组分析; 4、转录组:通过检测处理组(菌株+目标有机...
转录组代谢组联合分析 1/5 创建者:铁锅炖派蒙啊 收藏 【迈维代谢2021春季培训】第8讲:转录组+代谢组文章复盘-数据挖掘与高频作图分享 4192播放 【迈维课堂】转录组+代谢组数据挖掘之20组样本如何发MP——迈维代谢 2866播放 多组学联合分析的数据架构和研究思路 8448播放 第14期云课堂:转录组、蛋白组以及代谢...
“转录组+代谢组”的关联分析方案,发文量和影响因子居高不下,成为超热门之选!代谢物反映生物体的真实生理状态,其变化直接导致表型的变化。通过“转录+代谢”关联,可将基因表达的起始和终止联系起来,以此来探究两者之间的表达差异,从而挖掘在基因表达过程中潜在的重要调控机制。
RNA-seq和根部转录组分析 6 差异表达基因的功能注释 7 序列对比与拼接 8 根系分泌物提取和非靶向代谢分析 9 SWATH 数据采集与分析 10 根染色和组织学 结果 1 短柄草根对禾谷镰刀菌(Fg)WT(CS3005)和DON缺陷菌株(Tri5突变体)的感染反应不同 为了研究Bd根在防御根病原体中的潜在作用,评估了Fg感染后Bd根的转...
2022年7月7日,山西农业大学杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室联合华中农业大学、北京工商大学、中国农业科学院作物科学研究所等单位完成了谷子代谢物驯化的遗传机制和抗炎效果研究,该研究以“Multi-omics analyses of 398 foxtail millet accessions reveal genomic regions associated with domestication, metabolite tra...
2、代谢组:鉴定菌株在降解目标有机物时的中间产物,在对该有机物的生化反应有充分了解的基础上,可初步推测该菌株的生物降解途径; 3、基因组:一方面提供该菌株的基因组组装和注释信息,作为转录组分析的参考基因组;一方面也可与已知基因组的类似菌株联合进行比较基因组分析; ...
RNA-seq和根部转录组分析 6 差异表达基因的功能注释 7 序列对比与拼接 8 根系分泌物提取和非靶向代谢分析 9 SWATH 数据采集与分析 10 根染色和组织学 结果 1 短柄草根对禾谷镰刀菌(Fg)WT(CS3005)和DON缺陷菌株(Tri5突变体)的感染反应不同 为了研究Bd根在防御根病原体中的潜在作用,评估了Fg感染后Bd根的转...