🔪 CUT-Tag:通过蛋白特异性抗体引导Protein A-Tn5酶在目标蛋白结合的DNA位置进行切割,并在序列两端加上测序接头,经过PCR扩增后形成可用于高通量测序的文库。CUT-Tag无需超声打断,也无需传统连接法添加测序接头,操作简便、周期短、信噪比高、重复性好,且适用于低细胞起始量。特别适合组蛋白修饰的研究,但目前在转录...
Cut&Tag产物可以跑PCR,需要在8-10DNA提取之后加入Stop Buffer,95度五分钟,磁力架取上清跑Q。 CDNA保存时间 ⏳ CDNA在-20度只能保存1-2周,如果需要跑Q可能需要重复试验。胶没有2100敏感,转录因子跑胶可能没有东西但是能测序,看我的胶图我感觉20就不用浪费产物了直接送质检,40左右可以挣扎一下跑个胶,我一般...
1.发现了转录因子ONECUT3在MDS中异常高表达,与MDS的复杂核型和生存预后不佳显著相关。 2.在p53-WT MEF和p53-KO MEF上通过逆转录病毒构建可诱导ONECUT3过表达,可观察到ONECUT3可诱导多核细胞和复杂核型(假二倍体和多倍体)的表型产生...
转录因子CUT&Tag,不得不说的“伤痛” 转录因子是一类特殊的蛋白质,通过与DNA特定序列结合,调控基因转录过程。CUT&Tag可以在活细胞中检测全基因组范围内转录因子的结合位点,是研究转录因子调控机制的利器。 但“高速运转”的细胞动态发生着转录翻译的生命活动,由于转录因子与基因组的结合具有动态或间接的特点,并非一直牢...
这样多控点组合,常常发生转录因子CUT&Tag文库产出低、TSS富集差,IGV信号低的情况。 诺禾致源怎么做? 在市场主流实验基础上优化搭建“诺禾特色CUT&Tag技术平台”,且积累不同转录因子在不同样本基因组上结合位点与丰度信息库。 01打造更加适配动、植物样本裂解的实验SOP(关键环节) ...
（2）CUT&Tag技术也可以用于研究转录因子结合位点以及组蛋白的修饰情况。与ChIP-seq相比，CUT&Tag处理流程更快、分辨率更高、背景信号更低、所需的样本量更少。但是，CUT&Tag技术也需要获得稳定的遗传转化植株，因此不适用于一些没有稳定遗传转化体系的物种。除此之外，基于原生质体体系的CUT&Tag技术（pCUT&Tag）不...
《转录因子CUTL1通过SRC和ADAM22调控恶性黑素瘤转移的机制研究》是依托中国人民解放军第四军医大学，由樊星担任项目负责人的面上项目。项目摘要 转录因子在恶性黑素瘤的发生发展中发挥重要调控作用。本课题组既往发现转录因子CUTL1可通过调节细胞周期蛋白促进恶性黑素瘤的增殖。进一步研究发现CUTL1的升高...
(2)CUT&Tag技术也可以用于研究转录因子结合位点以及组蛋白的修饰情况。与ChIP-seq相比,CUT&Tag处理流程更快、分辨率更高、背景信号更低、所需的样本量更少。但是,CUT&Tag技术也需要获得稳定的遗传转化植株,因此不适用于一些没有稳定遗传转化体系的物种。除此之外,基于原生质体体系的CUT&Tag技术(pCUT&Tag)不需要转...
(2)CUT&Tag技术也可以用于研究转录因子结合位点以及组蛋白的修饰情况。与ChIP-seq相比,CUT&Tag处理流程更快、分辨率更高、背景信号更低、所需的样本量更少。但是,CUT&Tag技术也需要获得稳定的遗传转化植株,因此不适用于一些没有稳定遗传转化体系的物种。除此之外,基于原生质体体系的CUT&Tag技术(pCUT&Tag)不需要转...