除此之外，CUT&Tag在其他研究领域也不可或缺。在转录因子结合位点鉴定方面，CUT&Tag能够精确鉴定转录因子在基~因组上的结合位点，揭示其在基~因表达调控中的作用。在单细胞表观组学中，由于CUT&Tag技术对样本量的需求极低，单细胞CUT&Tag能够揭示细胞群体中个体细胞的异质性及染色质状态的差异。
CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一种专注于DNA-蛋白互作研究的革新性工具，主要用于识别转录因子或组蛋白修饰在全基~因组范围内的结合位点。CUT&Tag分析利用酶切与转座酶标记技术，精准定位转录因子或组蛋白修饰在基~因组中的结合位点，助力研究DNA-蛋白互作机制，为基~因组和表观遗传学研究提...
在研究中，CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合，分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平，尤其是启动子或增强子区域的靶基因，探究其对基因表达的调控作用。当目标蛋白为转录因子时，联合motif分析和共表达分析，研究可以进一步丰富转录因子-靶基因调控网络。同时，研究中会通过选择CUT&Tag和RNA-seq结果中的一些代表性位点...
CUT&Tag技术已被广泛应用于不同物种中,用来绘制组蛋白修饰和转录因子的图谱,帮助理解它们与各种生理和病理过程之间的关联,促进解析目标蛋白在疾病发展、细胞功能及生命过程的调控机制。 在研究中,CUT&Tag结果通常会与RNA-seq结合,分析目标蛋白结合位点附近的基因表达水平,尤其是启动子或增强子区域的靶基因,探究其对基因...
利用 CUT&Tag 获得的大量数据,可以分析转录因子等调控因子与靶基因的结合情况,进而构建出基因调控网络。这有助于深入理解基因表达调控的机制,发现新的调控关系和关键节点。例如,研究人员可以通过比较不同细胞状态或发育阶段的基因调控网络,揭示基因表达调控的动态变化,为疾病发生发展机制的研究和治疗提供新的思路。 参考...
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对HCT 116细胞进行CUT&Tag实验。 2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751对低细胞数量的NCCIT细胞进行CUT&Tag实验。 二、转录因子和辅因子分析 1、使用Nanog (D2A3) XP Rabbit mAb (Mouse Specific) #8822对F9细...
单细胞 CUT&Tag 分析 随着10X、BD等平台技术的推进，单细胞层面解析表达和开放染色质水平的研究方法已经得到很好的建立，并且在动植物种中都得到了很好的尝试。对于研究特定组蛋白修饰或转录因子结合的染色质区域的单细胞分析在技术上具有挑战性。今天小编和大家分享一篇今年四月份发表于Nature Biotechnology 的article 《...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基因组上的结合或分布位点。相比于传统的ChIP-seq技术,CUT&Tag反应在细胞内进行,创新性地使用了ProteinA/G-Tn5融合蛋白来结合目的蛋白上的抗体,并特异性切割目的蛋白结合的DNA,最终通过结合NGS实...
CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种新型DNA-蛋白互作研究技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基~因组上的结合位点。CUT&Tag的核心原理是利用抗体识别目标蛋白或特定的染色质修饰标记,并通过蛋白酶Tn5转座酶(Tagmentase)在目标位点上进行高效的DNA片段化和文库构建。Stephen Henikoff团队于2019...
转录因子CUT&Tag,不得不说的“伤痛” 转录因子是一类特殊的蛋白质,通过与DNA特定序列结合,调控基因转录过程。CUT&Tag可以在活细胞中检测全基因组范围内转录因子的结合位点,是研究转录因子调控机制的利器。 但“高速运转”的细胞动态发生着转录翻译的生命活动,由于转录因子与基因组的结合具有动态或间接的特点,并非一直牢...