Stephen Henikoff团队于2019年研发了CUT&Tag,作为ChIP-Seq(免疫共沉淀测序)的改进和替代方法。CUT&Tag技术凭借其高灵敏度、低背景噪音和低细胞量需求,已成为揭示基~因调控机制、解析染色质状态和推动精准yi学研究的重要工具,并广泛应用于表观遗传学研究、转录因子结合位点分析、疾bing机制解析、yao物筛选与作用机制...
CUT&Tag主要用于解决DNA与蛋白的互作关系,主要研究对象有转录因子、组蛋白修饰等。 ▶ 研究对象 (1)转录因子可以单独或与其他蛋白形成复合体,提高或阻断特定基因对RNA聚合酶的招募,从而达到调控基因表达的作用。转录因子包含一个或多个DNA结合域,通过结合域与基因附近的DNA序列结合,完成调控。研究转录因子功能,避不...
CUT&Tag使用ProteinA/G-Tn5融合蛋白直接结合目标蛋白,免除了传统方法的交联步骤,大幅降低背景噪声,并实现高分辨率的结合位点检测。相比传统ChIP-seq技术,CUT&Tag更适用于微量样本,特别是在组蛋白修饰和转录因子结合位点研究中展现卓越性能,是揭示基~因调控机制的强大工具,为疾bing研究和yao物开发提供了高效解决方案...
相比传统ChIP-seq技术,CUT&Tag更适用于微量样本,特别是在组蛋白修饰和转录因子结合位点研究中展现卓越性能,是揭示基~因调控机制的强大工具,为疾bing研究和yao物开发提供了高效解决方案。 我们提供的CUT&Tag分析依托先进的Protein A/G-Tn5融合蛋白体系和高通量测序平台,专注于解析蛋白质-DNA互作,特别是转录因子结合位点...
CUT&Tag技术的简介 众所周知,染色质免疫沉淀(ChIP)是分析转录因子和辅因子与DNA的结合以及组蛋白和组蛋白修饰在整个基因组中的定位的金标准技术。但是该技术步骤繁琐,耗时长,需要的起始样本量很高,而很多研究很难获得足够量的样本开展该实验。随着二代测序技术的发展,ChIP-seq提高了数据的解读通量,但是ChIP技术...
CUT&Tag在植物上的应用 2019年Kaya-Okur等人首先在哺乳动物中使用CUT&Tag技术提供了高分辨率测序来分析不同的染色质组分,通过在低样本量和单细胞水平分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子的表达证明了CUT&Tag技术的实用性 (Kaya-Okur et al., 2019)。这是首次运用CUT&Tag技术进行动物细胞组蛋白修饰及转录因子结...
在进行CUT&Tag实验时,首先进行靶蛋白特异性抗体(一抗)孵育,使抗体进入细胞与靶蛋白结合。为了放大信号,同理接着进行二抗孵育。最后孵育pAG-Tn5转座体,使得转座体进入细胞并与抗体结合,这样就把转座体间接的固定在靶蛋白上,随后加入Mg2+,激活Tn5酶的切割活性,切断靶蛋白结合的DNA区域。由于Tn5连有测序接头,...
在基于二代短读段测序平台的CUT&Tag相关技术研究中,Tn5转座酶需要分别在具有染色质修饰(组蛋白修饰或转录因子结合)的基因组DNA的两侧进行转座,从而在短DNA片段(通常为200bp-500bp)的两端连接上测序接头,且只有双端带有不同测序接头的短D...
CUT&Tag目前的价格比较稳定,如果你有数据分析能力,即可自己购买试剂盒建库,再交由测序公司进行扩增测序,自己再对原始数据进行分析,将会剩下一大笔费用。 CUT-Tag下机数据处理 1.下机数据 CUT-Tag本质上是对转录因子所下拉得DNA序列进行二代测序,因此下机数据和转录组的所类似为fsatq序列。
Stephen Henikoff团队于2019年研发了CUT&Tag,作为ChIP-Seq(免疫共沉淀测序)的改进和替代方法。CUT&Tag技术凭借其高灵敏度、低背景噪音和低细胞量需求,已成为揭示基~因调控机制、解析染色质状态和推动精准yi学研究的重要工具,并广泛应用于表观遗传学研究、转录因子结合位点分析、疾bing机制解析、yao物筛选与作用机制...