优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结合其他生信分析网站,如catRAPID、RBPDB等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的RIP-Seq互作组数据(湿实验数据),进行初步分析,然后再用AlphaFold3进行预测验证,将会提高互作机制研究的成...
优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结合其他生信分析网站,如catRAPID、RBPDB等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的RIP-Seq互作组数据(湿实验数据),进行初步分析,然后再用AlphaFold3进行预测验证,将会提高互作机制研究的成...
蛋白质与RNA互作是指蛋白质与RNA分子之间的相互作用。这种互作在生物体内广泛存在，参与基因表达调控、RNA加工和转运等多种生命过程。蛋白质通过与RNA结合，影响RNA的结构和功能，进而调控生物体的生理和病理过程。那么如何用AlphaFold3预测蛋白质与RNA互作呢？AlphaFold3给蛋白质与RNA互作预测提供了新的方法和工具。如遇...
优点:利用AlphaFold3预测蛋白与靶RNA互作,目前大概是生信预测类中最准确的方法。充分使用该工具,make it(互作机制研究) easier。建议结合其他生信分析网站,如catRAPID、RBPDB等网站(干实验数据),或充分整合自己项目的RIP-Seq互作组数据(湿实验数据),进行初步分析,然后再用AlphaFold3进行预测验证,将会提高互作机制研究的成...
lncRNA常常被当作一种功能元件,lncRNA通过与结合蛋白互作来发挥其一定的生物学功能,所以lncPro的主要功能就是预测lncRNA与目标蛋白互作的得分,从而从生物信息学的角度判断lncRNA与protein是否有互作 lncPro的基本原理是将RNA sequence和protein sequence转换为数值型向量,并利用矩阵的乘法来计算RNA与蛋白质的得分 ...
我们团队紧跟互作机制研究热点,可以协助您的项目,使用AlphaFold3工具进行预测分析。另外,我们团队长期聚焦互作机制研究的湿实验技术服务,如RIP-Seq互作组检测、RIP-qPCR互作蛋白验证、修饰互作验证、环境条件互作验证、互作调控机制探索等实验,协助您轻松突破互作机制
这个RNA与蛋白互作 不是测定分子间相互作用力吗 我们用仪器检测 亲和力大小强弱 预测的网站 不准吧~ bright8 有分子互做仪,直接测出来就好啦。 muchong5577 看看这个是否对你有帮助咯:http://swissmodel.expasy.org 根本扛不住 http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_omics_group 这个网站,比较常用的一...
这个网站，比较常用的一个RNA与蛋白质互作的网站 http://pridb.gdcb.iastate.edu/RPISeq/ 这个预测特定...
那么如何用AlphaFold3预测蛋白质与RNA互作呢? 第一步,通过Uniport网站获取候选基因的蛋白质序列(以MYC为例)。 第二步,通过NCBI获取RNA序列(以lncRNA H19为例)。 第三步,访问 AlphaFold Server(AlphaFold Server需要科学上网,而且建议使用Google浏览器,使用谷歌账号登录)和输入数据进行预测。
那么如何用AlphaFold3预测蛋白质与RNA互作呢? 第一步,通过Uniport网站获取候选基因的蛋白质序列(以MYC为例)。 第二步,通过NCBI获取RNA序列(以lncRNA H19为例)。 第三步,访问 AlphaFold Server(AlphaFold Server需要科学上网,而且建议使用Google浏览器,使用谷歌账号登录)和输入数据进行预测。