(g++ -Wall -O2 -std=c++0x -o build_matrix /data/jyu/program/soft/HiC-Pro-master/scripts/src/build_matrix.cpp; mv build_matrix /data/jyu/program/soft/HiC-Pro-master/scripts)(g++ -Wall -O2 -std=c++0x -o cutsite_trimming /data/jyu/program/soft/HiC-Pro-master/scripts/src/cutsite_tri...
conda config--setshow_channel_urlsyes 因为HiC-Pro只支持python2,自带的miniconda3是用python3编辑的,防止后面出现错误,建议安装miniconda2。(这个是之前写的,你也可以使用conda创建python2的虚拟环境) 1.3 依赖软件的安装 conda install-y samtools bowtie2 R conda install-y pysam bx-python numpy scipy 1.4 ...
如果用conda建立的依赖环境,这个文件不需要做任何修改,直接makecongfigure就可以了。 如果是自己手动配置HiC-Pro运行环境,就去修改config-install.txt文件,指定依赖的位置。 我之所以一直报错,就是用conda安装了运行环境,还去修改了config-install.txt文件,结果不行。
首先,下载HiC-Pro软件。 wget-c https://github.com/nservant/HiC-Pro/archive/refs/tags/v3.1.0.tar.gz tar-zxvf v3.1.0.tar.gz cdHiC-Pro-3.1.0 然后,构建运行环境,建议采用以下代码在conda环境中安装。conda env create -f environment.yml 含义 conda env create -f environment.yml -p hicpro 配...
适用产品: HUAWEI Mate X2(全网通 8gb+256gb、全网通 8gb+512gb),HUAWEI Mate 40 RS 保时捷设计(全网通 12gb+256gb、全网通 12gb+512gb、全网通 8gb+256gb),HUAWEI Mate 40 RS 保时捷设计 典藏版,HUAWEI Mate 40 Pro+,HUAWEI Mate 40 Pro(全网通 8gb+128gb、移动定制 8gb+256gb、全网通 8gb+256gb...
产品名称: 固定安装闭环霍尔电流传感器HIC-C21 型号: HIC-C21系列 价格: 请与商家联系 品牌: pas 产品介绍: 1.产品介绍 HIC-C21闭环霍尔电流传感器是一种利用霍尔闭环(磁平衡)原理将被测电流转换成按比例跟随输出的电流或电压的测量模块,原副边之间高度绝缘。具有高精确度、高线性度、高集成度、体积小结构...
一、hic-pro是什么,参考网页: [GitHub]https://github.com/nservant/HiC-Pro [DOCUMENTATION]http://nservant.github.io/HiC-Pro/ hic pro 将下机的fastq文件 SRR400264_00_R1.fastq.gz SRR400264_00_R2.fastq.gz 处理成有互作的 dixon_2M.allValidPairs ...
conda activate HicPro 回到Hic-Pro软件目录安装。 对Hic-Pro进行编译的时候会有报错 make or make install 会有以下报错: 报错原因:cat config-system.txt 中的内容默认安装的路径是/usr/local/bin/Hic-Pro_3.1.0,包括:SCRIPTS、SOURCES、ANNOT_DIR、CLUSTER_SCRIPT都是/usr/local/bin路径之下。(按道理安装在这...
conda安装Hic-Pro 关于在服务器集群上,非root用户如何使用conda安装Hic-Pro. 首先,要先安装有合适的安装包,去到https://github.com/nservant/HiC-Pro右侧https://github.com/nservant/HiC-Pro/releases可以提供更多版本。 可以直接下载通过: git clone https://github.com/nservant/HiC-Pro.git...
一、HiC-Pro软件安装 首先一个非常重要的问题,现在的Hic-Pro已经开始依赖python3了,网上很多的帖子还是python2,很快就不会再支持Python2了,一点要注意:我们看一下github上的描述吧: Github地址:https://github.com/nservant/HiC-Pro Conda建立HiC-Pro运行的依赖环境,按照github上说明, ...