首先,通过scRNA-seq(图2A)和scATAC-seq(图2B)分别鉴定了不同的细胞亚群:记忆B细胞(MBC),浆细胞(PC)和前体浆细胞/浆细胞母细胞(prePB/PB)。接着对scRNA-seq和scATAC-seq数据进行了整合分析,结果显示两组学数据集在MBC和PC阶段具有的良好的重叠(图2CD)。而来自ATAC-seq数据集的近一半的prePB未被预测为prePB,...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...
单细胞转录组分析通常指的单细胞 RNA 测序(single-cell RNA-seq,简称 scRNA-seq)数据分析。scRNA-seq 是一种研究单细胞的基因表达模式的方法,能够揭示细胞的异质性、功能和调控机制,在生物医药、细胞生物学等领域具有广泛应用。在AI for Science(AI4S)时代,我们可以利用机器学习技术来分析单细胞转录组数据,揭示细胞...
单细胞转录组测序是一种用于研究单个细胞基因表达的高通量测序技术。可以对单个细胞的RNA进行测序,从而可以了解到细胞种群的异质性和细胞间的差异性。通过单细胞转录组测序,可以深入了解单个细胞的基因表达特征,揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能等。 技术原理 单细胞RNA-seq 技...
scRNA_seq:单细胞转录组测序简介 欢迎关注”生信修炼手册”! 在传统的测序技术中,上机测序的样本是由多个细胞构成的,最后分析得出的结论也只是基于所有细胞的平均水平,但是我们知道细胞是具有异质性的,对于大脑等复杂组织而言,其细胞类型是多样的;对于肿瘤细胞而言,其细胞异质性更是尤为突出,为了克服细胞异质性的影响,...
近几十年来,越来越多的研究使用RNA-seq数据探索了肺癌的潜在预后标志物,并提高了我们对肿瘤发生和进展的理解,但这些预后特征是基于RNA-seq数据,它无法检测肿瘤样本中确切的细胞和分子变化。单细胞RNA测序(scRNA-seq)能够在单细胞水...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)研究揭示了山羊、小鼠和人类颗粒细胞和鞘细胞的异质性。然而关于关键发育事件、颗粒细胞异质性、功能注释和复杂的体细胞-卵母细胞相互通讯的基本问题在单细胞分辨率水平上仍未得到充分解决。此外不同类型颗粒细胞之间的通讯变化研究仍然有限,尤其是在家畜研究中。猪作为重要家畜和研究人类生殖...
一、介绍 用于单细胞RNA-seq数据 提供严格的质量控制:将原始测序读数处理为可用于下游分析的高质量表达数据集 提供了丰富的绘图工具套件 R包地址:http://bioconductor.org/packages/scater 二、工作流 三、常用函数 plotColData 代码语言:javascript 复制
单细胞双疾病联合bulk转录组测序GSEA富集分析CIBERSORT免疫浸润 10 0 00:04 App 转录组结果解读、转录组数据分析实操、WGCNA分析个性化数据 11.8万 4078 58:19:40 App 【整整600集】清华大学196小时讲完的Python教程(数据分析)零基础入门到精通全套教程,全程干货无废话!这还学不会,我退出IT圈!数据挖掘/可视化/...
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从...