单细胞之轨迹分析-3:monocle3 单细胞之轨迹分析-4:scVelo slingshot包可以对单细胞RNA-seq数据进行细胞分化谱系构建和伪时间推断。它利用细胞聚类簇和空间降维信息,以无监督或半监督的方式学习细胞聚类群之间的关系,揭示细胞聚类簇之间的全局结构,并将该结构转换为由一维变量表示的平滑谱系,称之为“伪时间”。 1. ...
轨迹分析系列：slingshot 包可以对单细胞RNA-seq数据进行细胞分化谱系构建和伪时间推断。它利用细胞聚类簇和空间降维信息，以无监督或半监督的方式学习细胞聚类群之间的关系，揭示细胞聚类簇之间的全局结构，并将该结构转换为由一维变量表示的平滑谱系，称之为“伪时间”。参考： Seurat对象、SingleCellExperi...
单细胞之轨迹分析-3:monocle3 单细胞之轨迹分析-4:scVelo slingshot包可以对单细胞RNA-seq数据进行细胞分化谱系构建和伪时间推断。它利用细胞聚类簇和空间降维信息,以无监督或半监督的方式学习细胞聚类群之间的关系,揭示细胞聚类簇之间的全局结构,并将该结构转换为由一维变量表示的平滑谱系,称之为“伪时间”。 1. ...