PAGODA(pathway and gene set overdispersion analysis)是一个分析单细胞测序的方法,主要特点是在已知的重要信号通路基础上对细胞进行分类,以提高统计效力并揭示可能的功能性解释。pagoda2可以用来进行细胞聚类,生成细胞-细胞距离矩阵等(其他软件如Seurat2也可以进行同样的操作)。 由于RNA速率分析velocyto.R是基于pagoda的cl...