RNA velocity原理此前已经介绍过,参考单细胞测序的轨迹推断。 1. loom文件准备 由于RNA velocity分析的前提是要我们从单细胞RNA-seq的数据中区分出未成熟的mRNA(unspliced)和成熟的mRNA(spliced),所以需要从fastq文件开始,与基因组进行比对后得到sam文件,从sam文件转成bam文件,再从bam文件中提取spliced,unspliced和amb...