5个蛋白编码基因在正常结肠组织中具有细胞类型特异性富集, CD86和TIMP2主要富集于树突状细胞(DC),而MMP2富集于成纤维细胞,FUT3富集于上皮细胞。 图4 用全蛋白质组孟德尔随机化方法鉴定结肠肿瘤组织中蛋白质编码基因的单细胞型表达 5. 治疗靶点潜力的蛋白相互作用和可药性评估 蛋白-蛋白相互作用分析发现,已鉴定的潜...
该文利用孟德尔随机化(MR)估计嗜碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞、淋巴细胞和中性粒细胞的循环白细胞(WBC)计数对结直肠癌风险的因果关系。研究表明外周血免疫细胞,特别是嗜酸性粒细胞和淋巴细胞,在结直肠癌的发展中有至关重要的作用。 一、背景 结直肠癌(CRC)占全球所有癌症病例的10%以上,是全球癌症相关死亡...
研究思路 基于已发表的全基因组关联研究(GWAS)汇总统计数据,采用双向双样本孟德尔随机化(MR)分析评估了肠道微生物群组成与脓毒症之间的关联,并进行敏感性分析以验证结果的稳健性。整合GWAS和表达数量性状位点(eQTL)数据对IV SNPs和暴露基因进行了MR分析,以确定关键基因。针对关键基因进行功能富集分析,利用单细胞数据集...
孟德尔随机化 每个微生物分类群暴露所使用的作为IV的基因变异范围包括3到22个SNP,F统计量范围为17到29,表明没有弱工具偏倚的证据。MR-PRESSO全局检验也没有提供多效性效应的证据(p > 0.05)。(附加文件1:表S1)。 基因和功能 SNP与基因及其功能之间的对应关系见附加文件6:表S6。GO分析显示,与疾病中有利结果相关...
作者通过综合分析多组学数据结合孟德尔分析,揭示了m6A甲基化在神经精神类疾病中的潜在作用,为未来的研究和治疗提供了新的视角和靶点。 5+绝好思路:m6A-qtl-临床问题定制分析biaodan.info/web/formview/663897f375a03c2416340b17 一、研究背景 作者通过整合大规模GWAS和人类m6 A-QTL数据集,对SCZ、BP、MDD、ADHD...
接下来,对MOD集群中的lncRNA和mRNA以及在IEU OpenGWAS数据库中发现的相关性状进行了双样本孟德尔随机化(MR)分析。 作者想要估计这些mRNA可能与IEU OpenGWAS数据库中发现的特征之间的因果关系。进行双样本MR检验。总共有52种mRNA被证明对217种与人体测量、脂质、血细胞组分等性状具有潜在的因果效应。
生信自学网-课程试学-可成药基因孟德尔随机化分析(MR+共定位+分子对接) 2770 -- 12:45 App 生信自学网-课程试学-泛凋亡文章套路视频(细胞凋亡、细胞焦亡和坏死性凋亡) 2208 -- 4:08 App 生信自学网-课程试学-2024新版TCGA数据下载和整理视频(转录组/临床/miRNA/突变) 414 -- 0:16 App 厉害了!单基因纯...
其中一个例子是EFEMP1,罕见突变与一种孟德尔型青光眼相关( 47 )。共定位分析表明,EFEMP1的第6和第7外显子的跳跃可能对POAG具有保护作用(附加图 12 )。在仅在POAG EUR GWAS中发现的9个位点中,有两个位点与作用于多个基因的eQTL共定位,包括参与细胞外基质(EMID1)和血管内皮生长(ANGPTL2)的基因,这两个位点也...
生信分析:掌握数据分析的关键❗🔥❗ #单细胞 #孟德尔 #生, 视频播放量 3、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 0, 视频作者 Ampilbaby, 作者简介 生信专业,博士研究生,已发表多篇sci,相关视频:【教程完结】Q1区7.7分,肿瘤单基因分析,生信+
鉴定出9个与中性粒细胞炎症相关的枢纽基因，其中5个基因与COPD患者肺功能呈负相关。通过孟德尔随机化分析进一步确认NAMPT和PTGS2是COPD的危险因素，为COPD中性粒细胞炎症和肺功能的检测提供了新的方法。这是非肿瘤疾病生信分析中的典型思路，从通路筛选到鉴定出与疾病相关的特征基因，随后以可获得的临床样本进行验证。