例如,有些基因在阿尔茨海默病(AD)或帕金森病(PD)患者的特定细胞类型中表达显著变化,这种“疾病依赖性基因效应”为理解脑疾病的致病机制提供了新的线索。此外,该研究进一步采用孟德尔随机化分析(Mendelian Randomization, MR),在未受疾病影...
1. 孟德尔随机化 通过逆方差加权(IVW)MR分析,确定了对主要结局脓毒症有因果影响的11个分类组,发现Lentisphaeria类丰度增加、粪球菌属、Dialiste属、毛螺菌科UCG004属、食物谷菌目、黏胶球形菌门与脓毒症呈正相关,而梭状芽胞杆菌科1科、Elogens属真杆菌属、Gordonibacter属、毛螺菌科ND3007属、 瘤胃球菌科UC...
孟德尔随机化是一种经典的遗传学实验方法,通过产生基因组的不同组合,揭示了遗传规律。而单细胞技术则是一种前沿的科技手段,可以对单个细胞进行高通量分析,揭示细胞之间的异质性。将孟德尔随机化和单细胞技术结合起来,我们能够更深入地了解个体之间的遗传差异和细胞异质性。这不仅为研究基因与疾病之间的关系提供了新的思...
1. 全基因组孟德尔随机化确定了COVID-19对41种细胞因子的因果影响 使用两个现有的GWAS荟萃分析数据集进行了MR分析,使用IVW和WM方法估计COVID-19与细胞因子之间的关联。此外,还进行了一系列敏感性分析,包括MR_Egger回归和留一法。结果发现27种细胞因子的MR结果显著,IVW和WM方法均显示,COVID-19可促进6种细胞因子...
1. 全基因组孟德尔随机化确定了COVID-19对41种细胞因子的因果影响 使用两个现有的GWAS荟萃分析数据集进行了MR分析,使用IVW和WM方法估计COVID-19与细胞因子之间的关联。此外,还进行了一系列敏感性分析,包括MR_Egger回归和留一法。结果发现27种细胞因子的MR结果显著,IVW和WM方法均显示,COVID-19可促进6种细胞因子...
欢迎大家私信咨询相关内容, 视频播放量 1748、弹幕量 0、点赞数 48、投硬币枚数 13、收藏人数 179、转发人数 44, 视频作者 医工科研UKB孟德尔, 作者简介 医工科研团队 致力于高效医学数据分析,研发UKB数据分析, MendelR代码包,云上GWAS,学员已发表170篇SCI,相关视频:最
鉴定与 IPF 相关的血清蛋白在发现阶段的 FDR 控制和验证阶段的复制后,作者发现 7 种蛋白的遗传升高血清水平会增加 IPF 的风险 (FLRT3、FN1、NRP1、SELPLG、SFTPB、SHBG 和 ST3GAL1),而 9 种蛋白的遗传升高血清水平可能会降低其风险 (CCL15、CFH、CFHR5、KLRB1、MTHFS、SCARF2、SERPINA1、SERPINF1 和 UROS)...
该数据集的分析表明,SCARF2 主要在上皮细胞中表达,与纤维化和正常患者相比,COPD 患者的 SCARF2 表达显著降低。然而,IPF 和正常肺组织之间 SCARF2 水平的差异并不显著。这些结果支持了在肺上皮细胞中靶向 SCARF2 治疗 COPD 的可能性。 UKB 中血清 SCARF2 蛋白与 COPD 的负相关分析共纳入 47,410 名参与者,...
🎉 最近,我发现了一个鲜为人知的领域,它将孟德尔随机化和单细胞技术巧妙地结合在一起,为我们提供了一个低投入但高回报的研究机会。🧬 🔬🌟 孟德尔随机化是一种经典的遗传学方法,通过生成不同的基因组合来揭示遗传规律。而单细胞技术则是一种前沿技术,可以对单个细胞进行高通量分析,揭示细胞间的异质性。📊...
其中一个例子是EFEMP1,罕见突变与一种孟德尔型青光眼相关( 47 )。共定位分析表明,EFEMP1的第6和第7外显子的跳跃可能对POAG具有保护作用(附加图 12 )。在仅在POAG EUR GWAS中发现的9个位点中,有两个位点与作用于多个基因的eQTL共定位,包括参与细胞外基质(EMID1)和血管内皮生长(ANGPTL2)的基因,这两个位点也...