3.经典单核细胞导致重症COVID-19患者CCL3表达降低 进一步构建了骨髓细胞亚型图谱,以评估CCL3在骨髓细胞亚型中的表达。髓细胞的重新聚集鉴定出四种细胞亚型:经典单核细胞(CMs)、中间单核细胞(IMs)、非经典单核细胞(ncm)和巨噬细胞。结果表明CMs是髓系细胞中CCL3表达显著降低的关键细胞亚型,CMs中CCL3表达降低与COVI...
细胞异质性与心血管疾病风险的孟德尔随机化分析:心血管疾病常伴有组织的细胞异质性变化。通过单细胞测序,结合孟德尔随机化,可以进一步揭示特定细胞类型的功能变化与疾病发生之间的因果关系。 单细胞层面的代谢途径异常与糖尿病发生的孟德尔随机化研究:利用单细胞技术,分析胰腺中不同细胞类型的代谢变化,运用孟德尔随机化方法,...
3. 经典单核细胞导致重症COVID-19患者CCL3表达降低 进一步构建了骨髓细胞亚型图谱,以评估CCL3在骨髓细胞亚型中的表达。髓细胞的重新聚集鉴定出四种细胞亚型:经典单核细胞(CMs)、中间单核细胞(IMs)、非经典单核细胞(ncm)和巨噬细胞。结果表明CMs是髓系细胞中CCL3表达显著降低的关键细胞亚型,CMs中CCL3表达降低与CO...
该数据集的分析表明,SCARF2 主要在上皮细胞中表达,与纤维化和正常患者相比,COPD 患者的 SCARF2 表达显著降低。然而,IPF 和正常肺组织之间 SCARF2 水平的差异并不显著。这些结果支持了在肺上皮细胞中靶向 SCARF2 治疗 COPD 的可能性。 UKB 中血清 SCARF2 蛋白与 COPD 的负相关分析共纳入 47,410 名参与者,包...
孟德尔随机化是一种经典的遗传学实验方法,通过产生基因组的不同组合,揭示了遗传规律。而单细胞技术则是一种前沿的科技手段,可以对单个细胞进行高通量分析,揭示细胞之间的异质性。将孟德尔随机化和单细胞技术结合起来,我们能够更深入地了解个体之间的遗传差异和细胞异质性。这不仅为研究基因与疾病之间的关系提供了新的思...
图4 用全蛋白质组孟德尔随机化方法鉴定结肠肿瘤组织中蛋白质编码基因的单细胞型表达 5. 治疗靶点潜力的蛋白相互作用和可药性评估 蛋白-蛋白相互作用分析发现,已鉴定的潜在致病蛋白之间的相互作用有限,仅发现了GREM1与CHRDL2之间的相互作用以及MMP2与TIMP2之间的相互作用,它们分别参与破骨细胞分化和肿瘤发生途径。在可...
鉴定与 IPF 相关的血清蛋白在发现阶段的 FDR 控制和验证阶段的复制后,作者发现 7 种蛋白的遗传升高血清水平会增加 IPF 的风险 (FLRT3、FN1、NRP1、SELPLG、SFTPB、SHBG 和 ST3GAL1),而 9 种蛋白的遗传升高血清水平可能会降低其风险 (CCL15、CFH、CFHR5、KLRB1、MTHFS、SCARF2、SERPINA1、SERPINF1 和 UROS)...
🎉 最近,我发现了一个鲜为人知的领域,它将孟德尔随机化和单细胞技术巧妙地结合在一起,为我们提供了一个低投入但高回报的研究机会。🧬 🔬🌟 孟德尔随机化是一种经典的遗传学方法,通过生成不同的基因组合来揭示遗传规律。而单细胞技术则是一种前沿技术,可以对单个细胞进行高通量分析,揭示细胞间的异质性。📊...
COPD 肺组织中皮细胞中 SCARF2 的低表达总共整合了来自正常 (n = 28)、COPD (n = 18) 和 IPF (n = 32) 的 716,074 个细胞,以表征 SCARF2 的表达。该数据集的分析表明,SCARF2 主要在上皮细胞中表达,与纤维化和正常患者相比,COPD 患者的 SCARF2 表达显著降低。然而,IPF 和正常肺组织之间 SCARF2 ...
孟德尔随机化文献推荐:单细胞视野下的新天地 Combining single-cell RNA sequencing and population-based studies reveals hand osteoarthritis-associated chondrocyte subpopulations and pathways - PMC (nih.gov) Integrating genetic regulation and single-cell expression with GWAS prioritizes causal genes and cell ...