分子模拟法是用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子的结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理与化学性质。分子模拟法不但可以模拟分子的静态结构,也可以模拟分子的动态行为(如分子链的弯曲运动、分子间的氢键与解缔行为、分子在表面的吸附行为、分子的扩散等)。该法能使一般的实验化学家、实验物理学家方便的使用分子...
分子模拟的简要介绍 在介绍分子动力学模拟方法之前,我们首先来认识一下分子模拟的概念,分子模拟是一种计算化学方法,它通过计算机程序模拟分子或分子体系的行为,以研究其结构、性质和相互作用。这种方法能够在原子或分子水平上提供对化学过程和物理现象的深入理解,是实验和理论化学的重要补充。分子模拟主要包括分子力学 ...
01 分子模拟的介绍 1.1 分子模拟的定义 分子模拟,顾名思义,是针对分子而进行的一种模型操作,即根据分子图形学原理,采用理论计算方法如量子力学、分子力学、分子动力学等在计算机上模拟或模仿分子行为的一门技术。 分子模拟技术赋予了我们洞察微观世界的能力,它使我们能够观察和操作那些在传统意义上无法直接观察的化学小...
分子模拟是指利用理论方法与计算技术,模拟或仿真分子运动的微观行为,广泛的应用于计算化学、计算生物学和材料科学领域,小至单个化学分子,大到复杂生物体系或材料体系都可以是它用来研究的对象。 1957年Alder等首先在硬球模型下采用分子动力学研究气体和液体的状态方程,开创了用分子动力学模拟方法研究物质宏观性质的先例。
分子模拟是对真实分子系统的计算机模拟,许多通过实验很难得到或无法得到的数据,通过模拟却可以轻松地获得,因为计算机可以清晰地展示分子的微观结构和计算材料力学性能等。真实分子的构象除了受势能影响外,还受到外部因素如温度、压力等条件的影响。分子模拟方法模拟原子的扩散、相变、薄膜生长、表面缺陷等过程,可得到原子...
分子模拟是现代化学和物理学的重要组成部分,尤其是对于大分子的研究。它们已经发展成为成熟的方法,可以有效地用于理解各种大分子体系结构与性质的关系。3月22日,清华大学化工系燕立唐教授课题组发表研究论文。无论是分子模拟领域入门者还是从事分子模拟相关方向的研究人员,这篇论文都将是一份极好的教程资料。其旨在厘清...
分子动力学模拟简介 分子动力学模拟是一种以分子的经典力学(分子力场)模型,通过数值求解分子体系的运动方程,研究分子体系的结构与性质的计算机模拟方法。分子动力学模拟的本质就是通过宏观性质来研究微观粒子的一种方法,这种方法使用牛顿运动定律来追踪分子体系中每个原子随时间的运动。分子动力学模拟是分子模拟中最接近...
分子模拟假说 分子模拟假说是2007年公布的免疫学名词,是指阐述自身免疫病机制的假说之一,认为某些微生物抗原与宿主自身抗原结构相似,故针对微生物抗原的特异性抗体或效应性T细胞可与相应宿主抗原产生反应,从而引起自身免疫病。
分子模拟是化学工业出版社出版图书。内容简介 分子模拟方法在物理、化学及材料学科等领域常常被称为“计算机实验”,它已经成为和实验科学、理论科学并列的自然科学的第三分支。本书介绍了基本原理,包括统计力学、Monte Carlo 模拟以及分子动力学模拟;然后介绍系综,包含不同系综的Monte Carlo 模拟以及不同系综的分子动力...