StringTie()能够应用流神经网络算法和可选的de novo组装进行转录本组装并预计表达水平。与Cufflinks 等程序相比,StringTie实现了更完整、更准确的基因重建, 并更好地预测了表达水平。Ballgown()是R语言中基因差 异表达分析的工具,能利用RNA-Seq实验的数据(StringT ...
Ballgown(https://github.com/alyssafrazee/ballgown)是R语言中基因差异表达分析的工具,能利用RNA-Seq实验的数据(StringTie, RSEM, Cufflinks)的结果预测基因、转录本的差异表达。然而Ballgown并没有不能很好地检测差异外显子,而 DEXseq、rMATS和MISO可以很好解决该问题。 一、数据下载 Linux系统下常用的下载工具是wge...
Ballgown (https://github.com/alyssafrazee/ballgown)是R语⾔中基因差异表达分析的⼯具，能利 ⽤RNA-Seq实验的数据(StringTie, RSEM, Cufflinks)的结果预测基因、转录本的差异表达。然⽽ Ballgown并没有不能很好地检测差异外显⼦，⽽ DEXseq、rMATS和MISO可以很好解决该问 题。⼀、数据下载 Linux系统...
Ballgown (https://http://doc.wendoc.com/alyssafrazee/ballgown)是R语言中基因差异表达分析的工具,能利用RNA-Seq实验的数据(StringTie, RSEM, Cufflinks)的结果预测基因、转录本的差异表达。然而Ballgown并没有不能很好地检测差异外显子,而DEXseq、rMATS和MISO可以很好解决该问题。 一、数据下载Linux系统下常用的...
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Ballgown(https://github.com/alyssafrazee/ballgown)是R语言中基因差异表达分析的工具,能利用RNA-Seq实验的数据(StringTie, RSEM, Cufflinks)的结果预测基因、转录本的差异表达。然而Ballgown并没有不能很好地检测差异外显子,而 DEXseq、rMATS和MISO可以很好解决该问题。
Ballgown(https://github.com/alyssafrazee/ballgown)是R语言中基因差异表达分析的工具,能利用RNA-Seq实验的数据(StringTie, RSEM, Cufflinks)的结果预测基因、转录本的差异表达。然而Ballgown并没有不能很好地检测差异外显子,而 DEXseq、rMATS和MISO可以很好解决该问题。