因此,通过药物筛选,发现洋地黄素和土霉素具有潜在的治疗作用。 6. circRNA-miRNA-mRNA调控网络构建 由DETMs预测的总共4674个基因,427条边。97个重叠基因被确定为进一步分析的指标。然后,我们整合了circRNA-miRNA网络和miRNA-mRNA调控网络,并使用Cytoscape构建了一个完整的circRNA-miRNA-mRNA调控网络网络(图7)。 7. RT...
如图5A所示的miRNA-mRNA网络,两个重叠的基因FYCO1和嘌呤富集元素结合蛋白A(PURA)受到三个差异表达miRNA(hsa-miR-17-5p,hsa-miR-20b-5p和hsa-miR-20a-5p)的调控。有趣的是,这三个miRNA在卵巢疾病的外泌体组织中上调,而这两个mRNA下调。这些结果表明,来自卵巢组织的外泌体携带的miRNA可能调控卵巢中一些关键mRNA...
Cytoscape 用于可视化。在分析中心基因时,四个 mRNA(PTGS2、CASP8、< /span>]。随后,构建了一个 miRNA-mRNA 网络,其中包含 16 个边(34、33、 32、31)被发现与 4 个 miRNA(miR -155-5p、miR-128-3p、miR-16-5p 和 miR-20a-5p)。这一发现与之前的研究结果一致[CD274 和 NFE2L2 研究人群的一般信息 ...
构建miRNA-mRNA调控网络鉴定关键靶基因,通过GEPIA分析Hub基因在PCa中的表达水平.结果:总共预测了20个上调和13个下调的DE-miRNA.其下游靶基因主要参与调控RNA转录,MAPK,AMPK,FoxO等信号传导通路,其中Hub基因IGF1,VEGFA和TNRC6A在PCa中的表达水平均显著下调(均P<0.05).结论:通过构建miRNA-mRNA调控模型,有助于了解...
在这项研究中,首次在 COPD 血浆中构建了潜在的 miRNA–mRNA 调控网络,这可能为 COPD 的发病机制和治疗提供新的见解。 关键词: 微小RNA(miRNA);慢性阻塞性肺疾病(COPD);生物信息学分析;miRNA–mRNA 调控网络 关注徳孚视频小程序 更多...
这三个风险基因和调控它们表达的四个miRNA(miR-200b-3p、miR-200c-3p,miR-10a-5p和miR-466)组成了一个预后调控网络,可能为HCC早期诊断的潜在标志物。与HCV相关肝硬化相比,HCV相关HCC中PABPC1、UHRF1和miR-466表达上调,而SLC2A9、miR-200b-3p、miR-200c-3p和miR-10a-5p表达下调。UHRF1作为原癌基因,...
和ｍｉＲＤＢ预测靶基因ꎬ最后通过Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ软件进行ＰＰＩ和ｍｉＲＮＡ￣ｍＲＮＡ调控网络可视化ꎮ㊀结果㊀通过筛选得到１５个差异ｍｉＲＮＡ和１７４个差异表达基因ꎮ通过ＧＯ和ＫＥＧＧ通路分析得到２５条ＧＯ功能注释ꎬ生物过程包括对药物的反应㊁血管生成㊁离子迁移㊁ＧＴＰａｓｅ介导...
脑神经胶质瘤替莫唑胺耐药circRNA-miRNA-mRNA调控网络的构建
mRNA(GSE145554)微阵列数据集,利用GEO2R获取差异表达的miRNA和mRNA,筛选具有靶向mRNA的差异表达miRNA并预测其上游潜在的转录因子;然后,将差异表达miRNA所靶向mRNA与GSE145554数据集所获取的差异表达mRNA取交集基因;最后,对交集基因实施GO和KEGG通路富集分析以揭示它们的生物学功能,构建交集基因PPI网络和miRNA-mRNA调控网络...
关键miRNA目标靶基因,进行目标靶基因GO和KEGG通路富集分析.通过String获取目标靶基因PPI关系文件,然后通过Cytoscape构建并分析miRNA-mRNA网络.结果 共得到6个与骨质疏松症疾病相关的关键miRNA,其中2个差异性上调,4个差异性下调,其主要转录因子为SP4,LHX3,NFIC,MYC和VSX2.通过将预测得到的关键miRNA靶基因和差异表达mRNA...