因此，分别计算了短链和长链中N对BD*( 1) S 2- O12的E2，结果如图，长链为7.90kcal/mol，短链为...
(一)定态一级微扰能量公式的推导 定态一级微扰能量公式是分子动力学理论中的常用公式。它可以用来计算原子或分子在不同状态之间的能量变化量,因而可以预测这些原子或分子发生反应时所需要的能量。定态一级微扰能量公式的推导基于分子动力学理论,主要可以分为四步: (1)首先,要求出原子或分子的初始状态的分子坐标$\math...
这里我们用了矩阵记号\left[E\right]_{mn}=E_m\delta_{mn}. 那么能量的n阶微扰项\left<\hat{H}\right>由 \begin{align} \left<\hat{H}^{\left(n\right)}\right> &= \left(-1\right)^{n+1}\frac{1}{\beta}\sum_{\omega}e^{i\omega 0^+} \text{Tr}\left[E\left(\mathcal{G}V\...
精准地计算结合自由能,一方面可以从模拟角度分析分子之间的相互作用,另一方面也可以为实验提供支撑并指导实验设计。本次,我们向大家介绍一种精确地自由能计算方法:自由能微扰(FEP)。 如下图所示,直接计算受体-配体之间的结合自由能是比较困难的,但是通过炼金术方法,可以将自由能的计算转化在热力学循环中。 (Chem. ...
自由能微扰方法是一种计算方法,用于研究系统在微扰下的自由能变化。其基本原理是通过引入微小的扰动,计算系统的响应,进而推断系统自由能的变化。这种方法在计算系统性质、相变行为和反应动力学等方面具有重要的应用价值。 二、应用案例 1. 材料科学领域:自由能微扰方法在材料的相变研究中发挥重要作用。例如,通过微扰计算...
如果相互作用部分比较小, 我们可以对它进行微扰展开. 费曼—戴逊图形展开方 法就是一种微扰展开的方法. 它在很多问题上取得了很大的成功. 但并非所有问 题都能解决. 比如在低能时, 量子色动力学用费曼—戴逊图形展开方法就不行. 在比如, 高温超导中的低掺杂情况, 也不能用微扰论来解决. 不过它是一个理解多...
自由能微扰计算 接下来,可以采用微扰展开的方法来计算系统的自由能。微扰展开是将系统的自由能用微扰哈密顿量的各阶项展开,然后计算每个阶项对自由能的贡献。 在一阶微扰论中,可以通过计算微扰哈密顿量在基态波函数上的期望值来得到系统的一阶微扰能量。这个期望值可以写成以下形式: $$ E_1=\langle0|H'|0\...
2021-12-02 App打开 麻省理工博士张朝阳的第一堂物理直播课,你觉得讲的咋样? 03-19 App打开 怎么才能在天上飞不掉下来?张朝阳的物理课告诉你 03-21 张朝阳的物理课出新招:微扰还能这么解 03-26 App打开 张朝阳的物理课:教你两种方法计算太阳的半径 相关...
自由能微扰 （英语：Free Energy Perturbation, 缩写：FEP）是用来计算自由能的一种常用方法。最早由R. W. Zwanzig在1954年提出。简介 自由能微扰（英语：FreeEnergyPerturbation,缩写：FEP）是用来计算自由能的一种常用方法。最早由R. W. Zwanzig在1954年提出。以正则系综为例，从状态A到状态B的自由能变化可以由下...