在实际模拟中,一个系统可能包含几千到几十万个原子,同时可能需要模拟几十万步或者更多,所以我们需要用专门的可进行并行计算的仿真软件对系统进行模拟。 分子动力学模拟 最常用的分子动力学仿真软件为LAMMPS,即为Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator的缩写。LAMMPS为美国Sandia国家实验室所开发的开源...
LAMMPS是一款广受欢迎的开源分子动力学软件,适用于模拟各种状态下的粒子系统,包括液态、固态和气态。它能够使用不同的力场和边界条件来模拟全原子、聚合物、生物、固态(如金属、陶瓷、氧化物)、粒状和粗粒化体系。LAMMPS的计算范围广泛,可以从小至几个粒子到大至数百万甚至数十亿个粒子的系统。LAMMPS的代码是可修改和...
第1步:输入lammps轨迹文件;第2步:随便输入一个数字,调出程序可以计算的数据。 Figure 4 操作过程 第3步:数据计算的内容,以HA键对分析为例;第4步:输入数字好像不合适,但是回车就可以进行到下一步;第5步:输入截断半径;第6步:输出文件的名字。 Figure 5 输出结果 下面是HA键对分析的结果。 === 以上说明过程...
LAMMPS免费一般性分子模拟软件。兼容当前大多数的势能模型，编程水平高，计算效率高。可以模拟软材料和固体物理系统。MaterialsExplorer立足于Windows平台的多功能分子动力学软件。拥有强大的分子动力学计算及MonteCarlo软件包，是结合应用领域来研究材料工程的有力工具。MaterialsExplorer可以用来研究有机物、高聚物、生物大分子...
LAMMPS是一个广泛使用的分子动力学模拟软件,可以用于模拟各种材料的结构和性质,如金属、聚合物、纳米颗粒等。它具有高度可扩展性和灵活性,可以进行并行计算和自定义代码开发。缺点是需要一定的编程知识来使用和定制。 GROMACS: GROMACS是另一个广泛使用的分子动力学模拟软件,主要用于生物分子的模拟,如蛋白质、核酸等。它...
4) LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator) 5) CHARMM (Chemistry at HARvard Molecular Mechanics) 这些软件包使用不同的模拟算法: 分子力场模拟 经典动力学模拟 量子力学/分子力学模拟… 在计算方面,分子动力学模拟通常可以在CPU或GPU上运行,具体取决于软件和计算资源的可用性。以下...
基于LAMMPS的单晶材料分子动力学模拟批处理软件是由北京工业大学著作的软件著作,该软件著作登记号为:2022SR0129327,属于分类,想要查询更多关于基于LAMMPS的单晶材料分子动力学模拟批处理软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
或者别的软件？2、 不同的软件各自有啥优缺点（特别是lammps与ADF中分子动力学的比较）谢谢了！
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